Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
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HOXD1Q9GZZ0 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HOXD1Q9GZZ0 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HOXD1Q9GZZ0 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HOXD1Q9GZZ0 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HOXD1Q9GZZ0 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HOXD1Q9GZZ0 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HOXD1Q9GZZ0 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
HOXD1Q9GZZ0 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
HOXD1Q9GZZ0 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
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HOXD1Q9GZZ0 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HOXD1Q9GZZ0 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HOXD1Q9GZZ0 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
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HOXD1Q9GZZ0 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HOXD1Q9GZZ0 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HOXD1Q9GZZ0 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
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HOXD1Q9GZZ0 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HOXD1Q9GZZ0 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HOXD1Q9GZZ0 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HOXD1Q9GZZ0 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HOXD1Q9GZZ0 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
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HOXD1Q9GZZ0 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HOXD1Q9GZZ0 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
HOXD1Q9GZZ0 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
HOXD1Q9GZZ0 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
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HOXD1Q9GZZ0 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
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HOXD1Q9GZZ0 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
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HOXD1Q9GZZ0 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
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HOXD1Q9GZZ0 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
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HOXD1Q9GZZ0 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
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HOXD1Q9GZZ0 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
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HOXD1Q9GZZ0 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
HOXD1Q9GZZ0 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
HOXD1Q9GZZ0 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
HOXD1Q9GZZ0 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC1.92□□□□□ -2.1
HOXD1Q9GZZ0 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC1.92□□□□□ -2.1
HOXD1Q9GZZ0 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
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HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HOXD1Q9GZZ0 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HOXD1Q9GZZ0 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HOXD1Q9GZZ0 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HOXD1Q9GZZ0 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
HOXD1Q9GZZ0 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HOXD1Q9GZZ0 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HOXD1Q9GZZ0 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HOXD1Q9GZZ0 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
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