Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC2.58□□□□□ -2
MEIS3Q99687 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC2.58□□□□□ -2
MEIS3Q99687 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC2.58□□□□□ -2
MEIS3Q99687 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC2.58□□□□□ -2
MEIS3Q99687 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC2.58□□□□□ -2
MEIS3Q99687 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC2.58□□□□□ -2
MEIS3Q99687 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC2.58□□□□□ -2
MEIS3Q99687 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC2.58□□□□□ -2
MEIS3Q99687 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC2.58□□□□□ -2
MEIS3Q99687 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC2.58□□□□□ -2
MEIS3Q99687 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC2.58□□□□□ -2
MEIS3Q99687 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC2.58□□□□□ -2
MEIS3Q99687 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC2.58□□□□□ -2
MEIS3Q99687 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC2.58□□□□□ -2
MEIS3Q99687 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC2.58□□□□□ -2
MEIS3Q99687 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC2.58□□□□□ -2
MEIS3Q99687 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC2.58□□□□□ -2
MEIS3Q99687 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC2.58□□□□□ -2
MEIS3Q99687 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC2.58□□□□□ -2
MEIS3Q99687 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
MEIS3Q99687 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC2.58□□□□□ -2
MEIS3Q99687 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC2.58□□□□□ -2
MEIS3Q99687 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC2.58□□□□□ -2
MEIS3Q99687 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC2.58□□□□□ -2
MEIS3Q99687 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
MEIS3Q99687 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.58□□□□□ -2
MEIS3Q99687 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
MEIS3Q99687 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
MEIS3Q99687 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
MEIS3Q99687 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
MEIS3Q99687 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC2.57□□□□□ -2
MEIS3Q99687 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC2.57□□□□□ -2
MEIS3Q99687 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC2.57□□□□□ -2
MEIS3Q99687 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC2.57□□□□□ -2
MEIS3Q99687 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC2.57□□□□□ -2
MEIS3Q99687 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
MEIS3Q99687 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC2.57□□□□□ -2
MEIS3Q99687 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC2.57□□□□□ -2
MEIS3Q99687 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC2.57□□□□□ -2
MEIS3Q99687 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC2.57□□□□□ -2
MEIS3Q99687 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC2.57□□□□□ -2
MEIS3Q99687 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC2.57□□□□□ -2
MEIS3Q99687 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC2.57□□□□□ -2
MEIS3Q99687 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC2.57□□□□□ -2
MEIS3Q99687 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC2.57□□□□□ -2
MEIS3Q99687 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC2.57□□□□□ -2
MEIS3Q99687 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC2.57□□□□□ -2
MEIS3Q99687 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC2.57□□□□□ -2
MEIS3Q99687 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC2.57□□□□□ -2
MEIS3Q99687 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC2.57□□□□□ -2
MEIS3Q99687 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC2.57□□□□□ -2
MEIS3Q99687 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC2.57□□□□□ -2
MEIS3Q99687 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC2.57□□□□□ -2
MEIS3Q99687 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
MEIS3Q99687 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC2.57□□□□□ -2
MEIS3Q99687 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC2.57□□□□□ -2
MEIS3Q99687 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
MEIS3Q99687 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC2.57□□□□□ -2
MEIS3Q99687 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC2.57□□□□□ -2
MEIS3Q99687 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC2.57□□□□□ -2
MEIS3Q99687 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
MEIS3Q99687 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
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MEIS3Q99687 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC2.56□□□□□ -2
MEIS3Q99687 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
MEIS3Q99687 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC2.56□□□□□ -2
MEIS3Q99687 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC2.56□□□□□ -2
MEIS3Q99687 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC2.56□□□□□ -2
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MEIS3Q99687 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC2.56□□□□□ -2
MEIS3Q99687 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC2.56□□□□□ -2
MEIS3Q99687 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
MEIS3Q99687 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC2.56□□□□□ -2
MEIS3Q99687 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.56□□□□□ -2
MEIS3Q99687 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC2.56□□□□□ -2
MEIS3Q99687 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC2.56□□□□□ -2
MEIS3Q99687 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC2.56□□□□□ -2
MEIS3Q99687 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC2.56□□□□□ -2
MEIS3Q99687 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC2.56□□□□□ -2
MEIS3Q99687 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC2.56□□□□□ -2
MEIS3Q99687 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC2.56□□□□□ -2
MEIS3Q99687 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
MEIS3Q99687 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC2.55□□□□□ -2
MEIS3Q99687 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC2.55□□□□□ -2
MEIS3Q99687 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC2.55□□□□□ -2
MEIS3Q99687 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC2.55□□□□□ -2
MEIS3Q99687 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.55□□□□□ -2
MEIS3Q99687 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC2.55□□□□□ -2
MEIS3Q99687 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC2.55□□□□□ -2
MEIS3Q99687 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC2.55□□□□□ -2
MEIS3Q99687 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
MEIS3Q99687 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC2.55□□□□□ -2
MEIS3Q99687 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC2.55□□□□□ -2
MEIS3Q99687 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
MEIS3Q99687 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC2.55□□□□□ -2
MEIS3Q99687 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC2.55□□□□□ -2
MEIS3Q99687 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
MEIS3Q99687 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
MEIS3Q99687 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
MEIS3Q99687 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC2.55□□□□□ -2
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