Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 MTND3P12-201ENST00000559068 328 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CCDC47Q96A33 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CCDC47Q96A33 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CCDC47Q96A33 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CCDC47Q96A33 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CCDC47Q96A33 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
CCDC47Q96A33 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CCDC47Q96A33 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CCDC47Q96A33 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CCDC47Q96A33 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CCDC47Q96A33 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CCDC47Q96A33 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CCDC47Q96A33 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
CCDC47Q96A33 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CCDC47Q96A33 AC010424.1-201ENST00000506336 297 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CCDC47Q96A33 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
CCDC47Q96A33 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
CCDC47Q96A33 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
CCDC47Q96A33 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CCDC47Q96A33 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
CCDC47Q96A33 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CCDC47Q96A33 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CCDC47Q96A33 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CCDC47Q96A33 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
CCDC47Q96A33 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CCDC47Q96A33 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CCDC47Q96A33 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CCDC47Q96A33 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CCDC47Q96A33 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CCDC47Q96A33 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CCDC47Q96A33 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CCDC47Q96A33 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CCDC47Q96A33 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CCDC47Q96A33 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
CCDC47Q96A33 USP9YP14-201ENST00000430663 563 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CCDC47Q96A33 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
CCDC47Q96A33 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
CCDC47Q96A33 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CCDC47Q96A33 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CCDC47Q96A33 LINC02500-201ENST00000512547 493 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
CCDC47Q96A33 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
CCDC47Q96A33 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CCDC47Q96A33 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC1.48□□□□□ -2.17
CCDC47Q96A33 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CCDC47Q96A33 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC1.48□□□□□ -2.17
CCDC47Q96A33 MIR3974-201ENST00000637126 96 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CCDC47Q96A33 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
CCDC47Q96A33 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
CCDC47Q96A33 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CCDC47Q96A33 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CCDC47Q96A33 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CCDC47Q96A33 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CCDC47Q96A33 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CCDC47Q96A33 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CCDC47Q96A33 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
CCDC47Q96A33 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CCDC47Q96A33 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CCDC47Q96A33 MTND1P26-201ENST00000440488 538 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CCDC47Q96A33 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CCDC47Q96A33 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CCDC47Q96A33 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CCDC47Q96A33 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CCDC47Q96A33 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
CCDC47Q96A33 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CCDC47Q96A33 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CCDC47Q96A33 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CCDC47Q96A33 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CCDC47Q96A33 EIF1P1-201ENST00000421436 341 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CCDC47Q96A33 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
CCDC47Q96A33 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CCDC47Q96A33 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CCDC47Q96A33 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CCDC47Q96A33 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CCDC47Q96A33 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CCDC47Q96A33 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
CCDC47Q96A33 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CCDC47Q96A33 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CCDC47Q96A33 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
CCDC47Q96A33 Y_RNA.77-201ENST00000362962 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CCDC47Q96A33 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CCDC47Q96A33 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CCDC47Q96A33 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CCDC47Q96A33 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CCDC47Q96A33 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CCDC47Q96A33 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CCDC47Q96A33 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CCDC47Q96A33 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CCDC47Q96A33 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC1.45□□□□□ -2.18
CCDC47Q96A33 AL158828.1-201ENST00000438582 197 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
CCDC47Q96A33 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
CCDC47Q96A33 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CCDC47Q96A33 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CCDC47Q96A33 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CCDC47Q96A33 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CCDC47Q96A33 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CCDC47Q96A33 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CCDC47Q96A33 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CCDC47Q96A33 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
CCDC47Q96A33 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CCDC47Q96A33 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
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