Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 WNK3-205ENST00000620763 5400 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TPRNQ4KMQ1 RNU1-89P-201ENST00000384592 164 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TPRNQ4KMQ1 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TPRNQ4KMQ1 RPL21P65-201ENST00000406094 466 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TPRNQ4KMQ1 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TPRNQ4KMQ1 AL691449.1-201ENST00000426570 421 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TPRNQ4KMQ1 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TPRNQ4KMQ1 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TPRNQ4KMQ1 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TPRNQ4KMQ1 AC099522.1-202ENST00000514718 367 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TPRNQ4KMQ1 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TPRNQ4KMQ1 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TPRNQ4KMQ1 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TPRNQ4KMQ1 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TPRNQ4KMQ1 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
TPRNQ4KMQ1 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TPRNQ4KMQ1 AL513302.2-201ENST00000562313 1842 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TPRNQ4KMQ1 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
TPRNQ4KMQ1 UACA-202ENST00000379983 4859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TPRNQ4KMQ1 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TPRNQ4KMQ1 FAN1-202ENST00000561594 2738 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
TPRNQ4KMQ1 DMXL1-201ENST00000311085 11072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
TPRNQ4KMQ1 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TPRNQ4KMQ1 EPC1-203ENST00000375110 3909 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
TPRNQ4KMQ1 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
TPRNQ4KMQ1 SUGT1-201ENST00000310528 14131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP130-201ENST00000364431 114 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TPRNQ4KMQ1 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TPRNQ4KMQ1 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TPRNQ4KMQ1 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TPRNQ4KMQ1 MIR1251-201ENST00000408552 70 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TPRNQ4KMQ1 AC112715.1-201ENST00000445534 350 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TPRNQ4KMQ1 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TPRNQ4KMQ1 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TPRNQ4KMQ1 AC020891.1-201ENST00000558785 174 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TPRNQ4KMQ1 ZNF616-203ENST00000597013 577 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TPRNQ4KMQ1 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TPRNQ4KMQ1 IGKV1OR2-6-201ENST00000603485 277 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TPRNQ4KMQ1 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
TPRNQ4KMQ1 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
TPRNQ4KMQ1 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
TPRNQ4KMQ1 DTWD1-201ENST00000251250 13776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
TPRNQ4KMQ1 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
TPRNQ4KMQ1 DDX60L-207ENST00000505890 4568 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TPRNQ4KMQ1 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TPRNQ4KMQ1 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TPRNQ4KMQ1 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TPRNQ4KMQ1 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TPRNQ4KMQ1 AL357552.1-201ENST00000445254 415 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TPRNQ4KMQ1 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TPRNQ4KMQ1 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TPRNQ4KMQ1 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TPRNQ4KMQ1 MIR6868-201ENST00000611215 58 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TPRNQ4KMQ1 MIR486-1-201ENST00000612171 68 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TPRNQ4KMQ1 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TPRNQ4KMQ1 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP399-201ENST00000364003 117 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TPRNQ4KMQ1 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TPRNQ4KMQ1 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TPRNQ4KMQ1 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TPRNQ4KMQ1 RPS4XP2-201ENST00000458402 793 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TPRNQ4KMQ1 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TPRNQ4KMQ1 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TPRNQ4KMQ1 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TPRNQ4KMQ1 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TPRNQ4KMQ1 C5orf42-205ENST00000508244 11062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TPRNQ4KMQ1 CRB1-201ENST00000367397 9023 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TPRNQ4KMQ1 AL161912.2-201ENST00000565707 3007 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TPRNQ4KMQ1 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
TPRNQ4KMQ1 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TPRNQ4KMQ1 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TPRNQ4KMQ1 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TPRNQ4KMQ1 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TPRNQ4KMQ1 RPS29P7-201ENST00000439662 171 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TPRNQ4KMQ1 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TPRNQ4KMQ1 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TPRNQ4KMQ1 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TPRNQ4KMQ1 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
TPRNQ4KMQ1 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
TPRNQ4KMQ1 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
TPRNQ4KMQ1 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
TPRNQ4KMQ1 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
TPRNQ4KMQ1 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
TPRNQ4KMQ1 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
TPRNQ4KMQ1 TBC1D31-210ENST00000521676 3256 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
TPRNQ4KMQ1 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
TPRNQ4KMQ1 AC093274.1-201ENST00000503488 5454 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
TPRNQ4KMQ1 IPO11-202ENST00000409296 3564 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
TPRNQ4KMQ1 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
TPRNQ4KMQ1 PPIP5K2-215ENST00000613674 4933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP322-201ENST00000363617 119 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
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