Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
NDUFA9Q16795 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NDUFA9Q16795 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
NDUFA9Q16795 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
NDUFA9Q16795 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NDUFA9Q16795 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NDUFA9Q16795 AC091435.1-201ENST00000505442 584 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NDUFA9Q16795 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
NDUFA9Q16795 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NDUFA9Q16795 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NDUFA9Q16795 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NDUFA9Q16795 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NDUFA9Q16795 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NDUFA9Q16795 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NDUFA9Q16795 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NDUFA9Q16795 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
NDUFA9Q16795 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NDUFA9Q16795 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NDUFA9Q16795 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NDUFA9Q16795 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NDUFA9Q16795 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NDUFA9Q16795 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.49□□□□□ -2.17
NDUFA9Q16795 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NDUFA9Q16795 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NDUFA9Q16795 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NDUFA9Q16795 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NDUFA9Q16795 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NDUFA9Q16795 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NDUFA9Q16795 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NDUFA9Q16795 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NDUFA9Q16795 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NDUFA9Q16795 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
NDUFA9Q16795 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
NDUFA9Q16795 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NDUFA9Q16795 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NDUFA9Q16795 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
NDUFA9Q16795 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
NDUFA9Q16795 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NDUFA9Q16795 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NDUFA9Q16795 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NDUFA9Q16795 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NDUFA9Q16795 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
NDUFA9Q16795 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
NDUFA9Q16795 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NDUFA9Q16795 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NDUFA9Q16795 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NDUFA9Q16795 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NDUFA9Q16795 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
NDUFA9Q16795 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NDUFA9Q16795 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
NDUFA9Q16795 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
NDUFA9Q16795 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NDUFA9Q16795 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
NDUFA9Q16795 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NDUFA9Q16795 RNY4P14-201ENST00000363656 96 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NDUFA9Q16795 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NDUFA9Q16795 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
NDUFA9Q16795 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NDUFA9Q16795 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NDUFA9Q16795 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NDUFA9Q16795 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
NDUFA9Q16795 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NDUFA9Q16795 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NDUFA9Q16795 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NDUFA9Q16795 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
NDUFA9Q16795 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
NDUFA9Q16795 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NDUFA9Q16795 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NDUFA9Q16795 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
NDUFA9Q16795 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NDUFA9Q16795 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NDUFA9Q16795 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
NDUFA9Q16795 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NDUFA9Q16795 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
NDUFA9Q16795 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NDUFA9Q16795 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NDUFA9Q16795 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NDUFA9Q16795 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NDUFA9Q16795 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NDUFA9Q16795 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NDUFA9Q16795 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NDUFA9Q16795 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NDUFA9Q16795 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.47□□□□□ -2.17
NDUFA9Q16795 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
NDUFA9Q16795 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
NDUFA9Q16795 AC025917.1-202ENST00000566344 635 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
NDUFA9Q16795 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
NDUFA9Q16795 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
NDUFA9Q16795 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
NDUFA9Q16795 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
NDUFA9Q16795 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
NDUFA9Q16795 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
NDUFA9Q16795 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
NDUFA9Q16795 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
NDUFA9Q16795 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
NDUFA9Q16795 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
NDUFA9Q16795 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
NDUFA9Q16795 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
NDUFA9Q16795 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
NDUFA9Q16795 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.5 ms