Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CLPPQ16740 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CLPPQ16740 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CLPPQ16740 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CLPPQ16740 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
CLPPQ16740 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CLPPQ16740 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
CLPPQ16740 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CLPPQ16740 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
CLPPQ16740 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CLPPQ16740 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CLPPQ16740 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CLPPQ16740 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CLPPQ16740 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
CLPPQ16740 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CLPPQ16740 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
CLPPQ16740 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
CLPPQ16740 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CLPPQ16740 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CLPPQ16740 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CLPPQ16740 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.68□□□□□ -2.14
CLPPQ16740 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CLPPQ16740 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CLPPQ16740 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CLPPQ16740 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CLPPQ16740 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CLPPQ16740 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CLPPQ16740 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CLPPQ16740 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CLPPQ16740 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CLPPQ16740 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CLPPQ16740 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CLPPQ16740 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CLPPQ16740 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CLPPQ16740 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CLPPQ16740 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
CLPPQ16740 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
CLPPQ16740 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CLPPQ16740 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
CLPPQ16740 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
CLPPQ16740 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CLPPQ16740 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CLPPQ16740 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CLPPQ16740 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
CLPPQ16740 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
CLPPQ16740 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
CLPPQ16740 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CLPPQ16740 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CLPPQ16740 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CLPPQ16740 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CLPPQ16740 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CLPPQ16740 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CLPPQ16740 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CLPPQ16740 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
CLPPQ16740 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CLPPQ16740 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CLPPQ16740 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
CLPPQ16740 LINC01691-201ENST00000450546 426 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
CLPPQ16740 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
CLPPQ16740 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
CLPPQ16740 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CLPPQ16740 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CLPPQ16740 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
CLPPQ16740 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CLPPQ16740 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
CLPPQ16740 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CLPPQ16740 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CLPPQ16740 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CLPPQ16740 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CLPPQ16740 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CLPPQ16740 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
CLPPQ16740 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CLPPQ16740 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CLPPQ16740 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
CLPPQ16740 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CLPPQ16740 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CLPPQ16740 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CLPPQ16740 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
CLPPQ16740 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
CLPPQ16740 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CLPPQ16740 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CLPPQ16740 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CLPPQ16740 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CLPPQ16740 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CLPPQ16740 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CLPPQ16740 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CLPPQ16740 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CLPPQ16740 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
CLPPQ16740 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CLPPQ16740 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CLPPQ16740 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
CLPPQ16740 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CLPPQ16740 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CLPPQ16740 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CLPPQ16740 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CLPPQ16740 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CLPPQ16740 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC1.65□□□□□ -2.14
CLPPQ16740 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CLPPQ16740 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
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