Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
ZFHX3Q15911 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
ZFHX3Q15911 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
ZFHX3Q15911 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
ZFHX3Q15911 Y_RNA.475-201ENST00000384345 101 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
ZFHX3Q15911 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
ZFHX3Q15911 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
ZFHX3Q15911 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
ZFHX3Q15911 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
ZFHX3Q15911 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
ZFHX3Q15911 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
ZFHX3Q15911 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
ZFHX3Q15911 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
ZFHX3Q15911 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
ZFHX3Q15911 RNU6-1005P-201ENST00000384519 107 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
ZFHX3Q15911 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
ZFHX3Q15911 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
ZFHX3Q15911 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
ZFHX3Q15911 AC104408.1-201ENST00000605241 170 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
ZFHX3Q15911 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
ZFHX3Q15911 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
ZFHX3Q15911 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
ZFHX3Q15911 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
ZFHX3Q15911 AL096799.1-201ENST00000425900 381 ntTSL 2 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
ZFHX3Q15911 USP9YP14-201ENST00000430663 563 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
ZFHX3Q15911 MRPL42P4-201ENST00000453267 443 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
ZFHX3Q15911 RNU6-932P-201ENST00000391108 106 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
ZFHX3Q15911 DPRXP1-201ENST00000426312 460 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
ZFHX3Q15911 SUMO2P5-201ENST00000506790 245 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
ZFHX3Q15911 AL355816.2-201ENST00000610049 647 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
ZFHX3Q15911 BTF3L4P1-201ENST00000413813 468 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
ZFHX3Q15911 AC093292.1-201ENST00000505050 449 ntTSL 3 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
ZFHX3Q15911 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
ZFHX3Q15911 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
ZFHX3Q15911 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
ZFHX3Q15911 SNORD56.4-201ENST00000363883 71 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
ZFHX3Q15911 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
ZFHX3Q15911 AL365338.1-201ENST00000422282 858 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
ZFHX3Q15911 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
ZFHX3Q15911 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
ZFHX3Q15911 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
ZFHX3Q15911 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
ZFHX3Q15911 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
ZFHX3Q15911 AL356596.1-201ENST00000624230 379 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
ZFHX3Q15911 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
ZFHX3Q15911 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
ZFHX3Q15911 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
ZFHX3Q15911 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
ZFHX3Q15911 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
ZFHX3Q15911 OFD1P4Y-201ENST00000455273 1179 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
ZFHX3Q15911 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
ZFHX3Q15911 MTND3P5-201ENST00000512798 333 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
ZFHX3Q15911 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
ZFHX3Q15911 AC027701.1-201ENST00000520155 823 ntTSL 3 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
ZFHX3Q15911 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
ZFHX3Q15911 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
ZFHX3Q15911 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
ZFHX3Q15911 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
ZFHX3Q15911 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
ZFHX3Q15911 HIGD1AP17-201ENST00000554576 276 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
ZFHX3Q15911 AL606834.3-201ENST00000602615 496 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
ZFHX3Q15911 AL358072.1-201ENST00000604156 575 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
ZFHX3Q15911 AL445264.1-201ENST00000621719 171 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
ZFHX3Q15911 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
ZFHX3Q15911 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
ZFHX3Q15911 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.31□□□□□ -2.46
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ZFHX3Q15911 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
ZFHX3Q15911 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
ZFHX3Q15911 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
ZFHX3Q15911 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
ZFHX3Q15911 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
ZFHX3Q15911 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
ZFHX3Q15911 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
ZFHX3Q15911 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
ZFHX3Q15911 AL355997.1-202ENST00000454361 610 ntTSL 3 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
ZFHX3Q15911 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
ZFHX3Q15911 NR2F2-AS1-208ENST00000560395 441 ntTSL 5 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
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ZFHX3Q15911 RN7SL660P-201ENST00000614852 299 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
ZFHX3Q15911 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
ZFHX3Q15911 USP9YP21-201ENST00000420603 432 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
ZFHX3Q15911 AC245297.3-203ENST00000612135 405 ntTSL 5 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
ZFHX3Q15911 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
ZFHX3Q15911 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
ZFHX3Q15911 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
ZFHX3Q15911 COX7BP2-201ENST00000437976 242 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
ZFHX3Q15911 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
ZFHX3Q15911 MTND4LP14-201ENST00000429447 288 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
ZFHX3Q15911 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
ZFHX3Q15911 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC-0.33□□□□□ -2.46
ZFHX3Q15911 RNA5SP180-201ENST00000516181 101 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
ZFHX3Q15911 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
ZFHX3Q15911 LINC00301-204ENST00000532591 470 ntTSL 2 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
ZFHX3Q15911 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
ZFHX3Q15911 MIR3115-201ENST00000577915 68 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
ZFHX3Q15911 AC100814.1-201ENST00000606963 623 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
ZFHX3Q15911 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
ZFHX3Q15911 AL603839.4-201ENST00000624658 1005 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
ZFHX3Q15911 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
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