Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 AC146944.4-201ENST00000602697 718 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
HMGN3Q15651 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
HMGN3Q15651 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
HMGN3Q15651 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
HMGN3Q15651 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
HMGN3Q15651 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
HMGN3Q15651 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
HMGN3Q15651 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
HMGN3Q15651 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
HMGN3Q15651 USP9YP28-201ENST00000435142 589 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
HMGN3Q15651 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
HMGN3Q15651 AC084149.2-201ENST00000438443 797 ntTSL 5 BASIC-0.74□□□□□ -2.53
HMGN3Q15651 AL157373.1-201ENST00000456036 276 ntTSL 3 BASIC-0.74□□□□□ -2.53
HMGN3Q15651 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
HMGN3Q15651 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
HMGN3Q15651 MIR5697-201ENST00000578045 78 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
HMGN3Q15651 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC-0.74□□□□□ -2.53
HMGN3Q15651 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC-0.74□□□□□ -2.53
HMGN3Q15651 DLG2-AS1_1.1-201ENST00000622319 213 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
HMGN3Q15651 AP000676.3-201ENST00000623299 569 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
HMGN3Q15651 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
HMGN3Q15651 snoZ40.1-201ENST00000364540 72 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
HMGN3Q15651 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
HMGN3Q15651 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
HMGN3Q15651 MIR1305-201ENST00000408300 86 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
HMGN3Q15651 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
HMGN3Q15651 SNORD126-201ENST00000459475 77 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
HMGN3Q15651 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
HMGN3Q15651 RNA5SP285-201ENST00000516619 119 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
HMGN3Q15651 AP003086.2-201ENST00000534168 437 ntTSL 3 BASIC-0.75□□□□□ -2.53
HMGN3Q15651 AC068790.2-201ENST00000602601 557 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
HMGN3Q15651 AC124016.2-201ENST00000610058 665 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
HMGN3Q15651 AC245297.3-203ENST00000612135 405 ntTSL 5 BASIC-0.75□□□□□ -2.53
HMGN3Q15651 PART1_2.1-201ENST00000612397 250 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
HMGN3Q15651 AC010975.3-201ENST00000618727 978 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
HMGN3Q15651 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
HMGN3Q15651 AC131159.1-201ENST00000621854 213 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
HMGN3Q15651 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
HMGN3Q15651 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
HMGN3Q15651 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
HMGN3Q15651 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
HMGN3Q15651 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
HMGN3Q15651 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
HMGN3Q15651 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
HMGN3Q15651 AL513412.1-201ENST00000445708 553 ntTSL 4 BASIC-0.76□□□□□ -2.53
HMGN3Q15651 ZNF736P5Y-201ENST00000451173 805 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
HMGN3Q15651 AL139824.2-201ENST00000458731 1095 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
HMGN3Q15651 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
HMGN3Q15651 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
HMGN3Q15651 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
HMGN3Q15651 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
HMGN3Q15651 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
HMGN3Q15651 ZNF971P-201ENST00000562068 1249 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
HMGN3Q15651 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
HMGN3Q15651 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
HMGN3Q15651 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC-0.77□□□□□ -2.53
HMGN3Q15651 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
HMGN3Q15651 SNORD14C-201ENST00000365382 88 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
HMGN3Q15651 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
HMGN3Q15651 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
HMGN3Q15651 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
HMGN3Q15651 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
HMGN3Q15651 ZNF886P-201ENST00000450781 723 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
HMGN3Q15651 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
HMGN3Q15651 AC023632.1-201ENST00000518463 375 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
HMGN3Q15651 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC-0.77□□□□□ -2.53
HMGN3Q15651 TMF1P1-201ENST00000576058 373 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
HMGN3Q15651 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
HMGN3Q15651 AL356596.1-201ENST00000624230 379 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
HMGN3Q15651 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
HMGN3Q15651 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
HMGN3Q15651 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
HMGN3Q15651 MIR892B-201ENST00000401279 77 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
HMGN3Q15651 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
HMGN3Q15651 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
HMGN3Q15651 AC006366.1-201ENST00000422002 759 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
HMGN3Q15651 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC-0.78□□□□□ -2.53
HMGN3Q15651 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC-0.78□□□□□ -2.53
HMGN3Q15651 AC007000.2-201ENST00000442564 487 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
HMGN3Q15651 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC-0.78□□□□□ -2.53
HMGN3Q15651 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
HMGN3Q15651 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
HMGN3Q15651 EPGN-208ENST00000509145 222 ntTSL 1 (best) BASIC-0.78□□□□□ -2.53
HMGN3Q15651 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
HMGN3Q15651 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC-0.78□□□□□ -2.53
HMGN3Q15651 AC012414.2-201ENST00000559474 187 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
HMGN3Q15651 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
HMGN3Q15651 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
HMGN3Q15651 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
HMGN3Q15651 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
HMGN3Q15651 AC006927.4-201ENST00000639187 543 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
HMGN3Q15651 SNORD51.1-201ENST00000365405 77 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
HMGN3Q15651 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
HMGN3Q15651 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
HMGN3Q15651 ERHP2-201ENST00000402323 299 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
HMGN3Q15651 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
HMGN3Q15651 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC-0.79□□□□□ -2.54
HMGN3Q15651 HSFY7P-201ENST00000432672 318 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
HMGN3Q15651 HSFY8P-201ENST00000437934 318 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
HMGN3Q15651 RNU7-165P-201ENST00000458864 60 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.7 ms