Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TTF1Q15361 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TTF1Q15361 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TTF1Q15361 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TTF1Q15361 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TTF1Q15361 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TTF1Q15361 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TTF1Q15361 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TTF1Q15361 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
TTF1Q15361 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
TTF1Q15361 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TTF1Q15361 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TTF1Q15361 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TTF1Q15361 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TTF1Q15361 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TTF1Q15361 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TTF1Q15361 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TTF1Q15361 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TTF1Q15361 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TTF1Q15361 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TTF1Q15361 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
TTF1Q15361 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TTF1Q15361 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TTF1Q15361 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
TTF1Q15361 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
TTF1Q15361 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TTF1Q15361 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TTF1Q15361 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TTF1Q15361 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
TTF1Q15361 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
TTF1Q15361 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
TTF1Q15361 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TTF1Q15361 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TTF1Q15361 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TTF1Q15361 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TTF1Q15361 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TTF1Q15361 XGY1-201ENST00000381172 446 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TTF1Q15361 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TTF1Q15361 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
TTF1Q15361 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TTF1Q15361 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
TTF1Q15361 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
TTF1Q15361 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
TTF1Q15361 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TTF1Q15361 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TTF1Q15361 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
TTF1Q15361 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TTF1Q15361 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TTF1Q15361 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
TTF1Q15361 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TTF1Q15361 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TTF1Q15361 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TTF1Q15361 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TTF1Q15361 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TTF1Q15361 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TTF1Q15361 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TTF1Q15361 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TTF1Q15361 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TTF1Q15361 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
TTF1Q15361 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TTF1Q15361 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TTF1Q15361 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
TTF1Q15361 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TTF1Q15361 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TTF1Q15361 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TTF1Q15361 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TTF1Q15361 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TTF1Q15361 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TTF1Q15361 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TTF1Q15361 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
TTF1Q15361 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
TTF1Q15361 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TTF1Q15361 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TTF1Q15361 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TTF1Q15361 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TTF1Q15361 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TTF1Q15361 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TTF1Q15361 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TTF1Q15361 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TTF1Q15361 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TTF1Q15361 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TTF1Q15361 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TTF1Q15361 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TTF1Q15361 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TTF1Q15361 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TTF1Q15361 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TTF1Q15361 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TTF1Q15361 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TTF1Q15361 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
TTF1Q15361 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
TTF1Q15361 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TTF1Q15361 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TTF1Q15361 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TTF1Q15361 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TTF1Q15361 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TTF1Q15361 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TTF1Q15361 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TTF1Q15361 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TTF1Q15361 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TTF1Q15361 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.8 ms