Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
APOFQ13790 RNASEH2B-AS1-206ENST00000601286 657 ntTSL 5 BASIC0.77□□□□□ -2.29
APOFQ13790 AL670729.3-201ENST00000602345 574 ntTSL 4 BASIC0.77□□□□□ -2.29
APOFQ13790 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
APOFQ13790 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
APOFQ13790 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC0.77□□□□□ -2.29
APOFQ13790 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
APOFQ13790 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
APOFQ13790 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
APOFQ13790 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.76□□□□□ -2.29
APOFQ13790 FGF7P2-201ENST00000332473 296 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
APOFQ13790 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
APOFQ13790 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
APOFQ13790 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
APOFQ13790 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
APOFQ13790 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
APOFQ13790 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
APOFQ13790 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
APOFQ13790 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
APOFQ13790 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC0.76□□□□□ -2.29
APOFQ13790 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
APOFQ13790 AC013401.1-202ENST00000422017 626 ntTSL 2 BASIC0.76□□□□□ -2.29
APOFQ13790 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC0.76□□□□□ -2.29
APOFQ13790 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC0.76□□□□□ -2.29
APOFQ13790 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
APOFQ13790 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
APOFQ13790 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
APOFQ13790 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
APOFQ13790 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
APOFQ13790 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
APOFQ13790 AL139147.1-201ENST00000502413 1156 ntTSL 2 BASIC0.76□□□□□ -2.29
APOFQ13790 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC0.76□□□□□ -2.29
APOFQ13790 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC0.76□□□□□ -2.29
APOFQ13790 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC0.76□□□□□ -2.29
APOFQ13790 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
APOFQ13790 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC0.76□□□□□ -2.29
APOFQ13790 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
APOFQ13790 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
APOFQ13790 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
APOFQ13790 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
APOFQ13790 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
APOFQ13790 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
APOFQ13790 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
APOFQ13790 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
APOFQ13790 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
APOFQ13790 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
APOFQ13790 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
APOFQ13790 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
APOFQ13790 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
APOFQ13790 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
APOFQ13790 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
APOFQ13790 AC002456.1-201ENST00000415965 317 ntTSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
APOFQ13790 AC013410.2-201ENST00000422627 201 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
APOFQ13790 MTCO2P11-201ENST00000431069 680 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
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APOFQ13790 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
APOFQ13790 MTND4P32-201ENST00000437189 1237 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
APOFQ13790 AL031667.1-201ENST00000440222 725 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
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APOFQ13790 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
APOFQ13790 AC007494.3-201ENST00000624660 743 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
APOFQ13790 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
APOFQ13790 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.74□□□□□ -2.29
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APOFQ13790 RNU6-517P-201ENST00000384362 110 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
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APOFQ13790 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
APOFQ13790 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
APOFQ13790 AC009299.3-201ENST00000421122 1072 ntTSL 3 BASIC0.74□□□□□ -2.29
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APOFQ13790 AL355314.1-201ENST00000453639 316 ntTSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
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APOFQ13790 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
APOFQ13790 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
APOFQ13790 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
APOFQ13790 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
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APOFQ13790 MIR3908-201ENST00000579798 126 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
APOFQ13790 AC068790.2-201ENST00000602601 557 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
APOFQ13790 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC0.74□□□□□ -2.29
APOFQ13790 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.74□□□□□ -2.29
APOFQ13790 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
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