Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TRAF1Q13077 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
TRAF1Q13077 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TRAF1Q13077 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TRAF1Q13077 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
TRAF1Q13077 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TRAF1Q13077 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TRAF1Q13077 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC2.59□□□□□ -1.99
TRAF1Q13077 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TRAF1Q13077 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TRAF1Q13077 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
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TRAF1Q13077 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TRAF1Q13077 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TRAF1Q13077 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TRAF1Q13077 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TRAF1Q13077 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TRAF1Q13077 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
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TRAF1Q13077 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
TRAF1Q13077 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
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TRAF1Q13077 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TRAF1Q13077 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TRAF1Q13077 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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TRAF1Q13077 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
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TRAF1Q13077 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.56□□□□□ -2
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TRAF1Q13077 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TRAF1Q13077 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
TRAF1Q13077 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TRAF1Q13077 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TRAF1Q13077 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
TRAF1Q13077 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
TRAF1Q13077 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TRAF1Q13077 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TRAF1Q13077 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TRAF1Q13077 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TRAF1Q13077 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC2.55□□□□□ -2
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