| ATP6AP1 | Q15904 | FANCD2-213 | ENST00000625535 | 117 nt | TSL 5 BASIC | 1.4 | □□□□□ -2.19 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | CYLC2-204 | ENST00000612124 | 1817 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 1.4 | □□□□□ -2.19 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | MTND5P9-201 | ENST00000503854 | 1755 nt | BASIC | 1.39 | □□□□□ -2.19 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC006026.1-201 | ENST00000444025 | 1803 nt | BASIC | 1.39 | □□□□□ -2.19 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AL356292.1-201 | ENST00000283110 | 373 nt | BASIC | 1.39 | □□□□□ -2.19 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | RNU6-545P-201 | ENST00000362681 | 104 nt | BASIC | 1.39 | □□□□□ -2.19 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | Y_RNA.318-201 | ENST00000365131 | 97 nt | BASIC | 1.39 | □□□□□ -2.19 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | DEFB125-201 | ENST00000382410 | 587 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 1.39 | □□□□□ -2.19 | | |
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| ATP6AP1 | Q15904 | C8orf59P1-201 | ENST00000429930 | 303 nt | BASIC | 1.39 | □□□□□ -2.19 | | |
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| ATP6AP1 | Q15904 | AC009754.1-201 | ENST00000566282 | 540 nt | TSL 4 BASIC | 1.39 | □□□□□ -2.19 | | |
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| ATP6AP1 | Q15904 | AL357054.2-201 | ENST00000607644 | 423 nt | TSL 5 BASIC | 1.39 | □□□□□ -2.19 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC068733.3-201 | ENST00000632757 | 269 nt | TSL 3 BASIC | 1.39 | □□□□□ -2.19 | | |
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| ATP6AP1 | Q15904 | AC097065.2-201 | ENST00000608159 | 533 nt | BASIC | 1.38 | □□□□□ -2.19 | | |
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| ATP6AP1 | Q15904 | AC024614.3-201 | ENST00000637860 | 256 nt | BASIC | 1.38 | □□□□□ -2.19 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | GAGE12B-201 | ENST00000361446 | 117 nt | APPRIS P1 BASIC | 1.37 | □□□□□ -2.19 | | |
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| ATP6AP1 | Q15904 | AC004866.1-201 | ENST00000411748 | 78 nt | BASIC | 1.37 | □□□□□ -2.19 | | |
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| ATP6AP1 | Q15904 | AC099677.2-201 | ENST00000436385 | 175 nt | BASIC | 1.37 | □□□□□ -2.19 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC004386.2-201 | ENST00000441858 | 148 nt | BASIC | 1.37 | □□□□□ -2.19 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AL357134.1-201 | ENST00000445848 | 426 nt | BASIC | 1.37 | □□□□□ -2.19 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC015983.2-201 | ENST00000446053 | 472 nt | TSL 3 BASIC | 1.37 | □□□□□ -2.19 | | |
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| ATP6AP1 | Q15904 | AC007395.1-201 | ENST00000451333 | 677 nt | BASIC | 1.37 | □□□□□ -2.19 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | MTND1P11-201 | ENST00000456661 | 876 nt | BASIC | 1.37 | □□□□□ -2.19 | | |
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| ATP6AP1 | Q15904 | AC063944.1-201 | ENST00000496943 | 295 nt | TSL 3 BASIC | 1.37 | □□□□□ -2.19 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | RPL23AP63-201 | ENST00000498752 | 471 nt | BASIC | 1.37 | □□□□□ -2.19 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | SNORA44.1-201 | ENST00000517031 | 108 nt | BASIC | 1.37 | □□□□□ -2.19 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | SUMO2P18-201 | ENST00000518873 | 252 nt | BASIC | 1.37 | □□□□□ -2.19 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC016957.1-201 | ENST00000534895 | 309 nt | BASIC | 1.37 | □□□□□ -2.19 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC009269.4-201 | ENST00000557828 | 440 nt | TSL 3 BASIC | 1.37 | □□□□□ -2.19 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | MIR3198-2-201 | ENST00000577868 | 80 nt | BASIC | 1.37 | □□□□□ -2.19 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | ZNFX1-AS1_2.1-201 | ENST00000610973 | 93 nt | BASIC | 1.37 | □□□□□ -2.19 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC083806.3-201 | ENST00000614016 | 455 nt | BASIC | 1.37 | □□□□□ -2.19 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AL138726.1-201 | ENST00000614873 | 333 nt | BASIC | 1.37 | □□□□□ -2.19 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | LINC01515-217 | ENST00000620859 | 694 nt | TSL 5 BASIC | 1.37 | □□□□□ -2.19 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | MPP6-209 | ENST00000625307 | 126 nt | TSL 5 BASIC | 1.37 | □□□□□ -2.19 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | PRPSAP2-229 | ENST00000628609 | 192 nt | TSL 5 BASIC | 1.37 | □□□□□ -2.19 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC068631.1-220 | ENST00000630726 | 256 nt | TSL 5 BASIC | 1.37 | □□□□□ -2.19 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AL159152.1-201 | ENST00000635019 | 2587 nt | BASIC | 1.37 | □□□□□ -2.19 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | SAGE1-202 | ENST00000370709 | 2879 nt | APPRIS P2 TSL 5 BASIC | 1.37 | □□□□□ -2.19 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC233981.2-201 | ENST00000611524 | 1614 nt | BASIC | 1.37 | □□□□□ -2.19 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | SNORD50.1-201 | ENST00000362987 | 71 nt | BASIC | 1.36 | □□□□□ -2.19 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | RNU4-40P-201 | ENST00000364351 | 143 nt | BASIC | 1.36 | □□□□□ -2.19 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | RNU6-877P-201 | ENST00000383868 | 107 nt | BASIC | 1.36 | □□□□□ -2.19 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | RNU6-418P-201 | ENST00000384035 | 107 nt | BASIC | 1.36 | □□□□□ -2.19 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | MIR181A1-201 | ENST00000385026 | 110 nt | BASIC | 1.36 | □□□□□ -2.19 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | TRAJ6-201 | ENST00000390531 | 62 nt | APPRIS P1 BASIC | 1.36 | □□□□□ -2.19 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | RNU6-955P-201 | ENST00000410497 | 104 nt | BASIC | 1.36 | □□□□□ -2.19 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AL590705.2-201 | ENST00000420204 | 281 nt | TSL 5 BASIC | 1.36 | □□□□□ -2.19 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | NCOR1P3-201 | ENST00000420479 | 303 nt | BASIC | 1.36 | □□□□□ -2.19 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | SIRPG-AS1-201 | ENST00000437384 | 410 nt | TSL 3 BASIC | 1.36 | □□□□□ -2.19 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | HMGB1P18-201 | ENST00000438801 | 619 nt | BASIC | 1.36 | □□□□□ -2.19 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | EHHADH-202 | ENST00000440662 | 656 nt | TSL 3 BASIC | 1.36 | □□□□□ -2.19 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | HSPE1P24-201 | ENST00000450782 | 238 nt | BASIC | 1.36 | □□□□□ -2.19 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | OR2AQ1P-201 | ENST00000451972 | 200 nt | BASIC | 1.36 | □□□□□ -2.19 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | HMGN2P23-201 | ENST00000456759 | 269 nt | BASIC | 1.36 | □□□□□ -2.19 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC087477.1-201 | ENST00000465747 | 340 nt | BASIC | 1.36 | □□□□□ -2.19 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | YWHAEP4-201 | ENST00000505390 | 198 nt | BASIC | 1.36 | □□□□□ -2.19 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | FAM206BP-201 | ENST00000510179 | 541 nt | BASIC | 1.36 | □□□□□ -2.19 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC008852.1-201 | ENST00000510198 | 451 nt | TSL 2 BASIC | 1.36 | □□□□□ -2.19 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC091944.1-201 | ENST00000521984 | 449 nt | TSL 3 BASIC | 1.36 | □□□□□ -2.19 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | MTND1P35-201 | ENST00000526739 | 508 nt | BASIC | 1.36 | □□□□□ -2.19 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC109635.3-201 | ENST00000529536 | 185 nt | BASIC | 1.36 | □□□□□ -2.19 | | |