Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.39□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 AC091435.1-201ENST00000505442 584 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC1.39□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC1.39□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC1.38□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 MTND3P21-201ENST00000433774 331 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 AC097065.2-201ENST00000608159 533 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC1.37□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 RNU4-40P-201ENST00000364351 143 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.36□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC1.36□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ATP6AP1Q15904 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.6 ms