Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
HMGN3Q15651 EEF1E1P1-201ENST00000446998 430 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
HMGN3Q15651 AC104692.1-201ENST00000472406 90 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
HMGN3Q15651 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC-0.67□□□□□ -2.52
HMGN3Q15651 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
HMGN3Q15651 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
HMGN3Q15651 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
HMGN3Q15651 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
HMGN3Q15651 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
HMGN3Q15651 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
HMGN3Q15651 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
HMGN3Q15651 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
HMGN3Q15651 RPS20P2-201ENST00000402520 389 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
HMGN3Q15651 MTCO2P7-201ENST00000446518 666 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
HMGN3Q15651 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
HMGN3Q15651 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
HMGN3Q15651 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
HMGN3Q15651 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
HMGN3Q15651 AC253576.2-201ENST00000618815 580 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
HMGN3Q15651 KLRF1-202ENST00000354855 838 ntTSL 1 (best) BASIC-0.69□□□□□ -2.52
HMGN3Q15651 SNORD114-31-201ENST00000363219 75 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
HMGN3Q15651 SNORD114-28-201ENST00000363610 72 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
HMGN3Q15651 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
HMGN3Q15651 AL663109.1-201ENST00000411498 844 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
HMGN3Q15651 AC096531.1-201ENST00000419107 107 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
HMGN3Q15651 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC-0.69□□□□□ -2.52
HMGN3Q15651 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
HMGN3Q15651 LINC00446-202ENST00000438327 357 ntTSL 3 BASIC-0.69□□□□□ -2.52
HMGN3Q15651 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
HMGN3Q15651 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
HMGN3Q15651 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
HMGN3Q15651 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
HMGN3Q15651 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
HMGN3Q15651 AC069114.1-201ENST00000580927 287 ntTSL 2 BASIC-0.69□□□□□ -2.52
HMGN3Q15651 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
HMGN3Q15651 AC122133.1-201ENST00000613964 233 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
HMGN3Q15651 AC120349.2-201ENST00000625002 298 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
HMGN3Q15651 RNA5SP257-201ENST00000363023 116 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
HMGN3Q15651 RNU6ATAC25P-201ENST00000408798 117 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
HMGN3Q15651 HIGD1AP15-201ENST00000416198 280 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
HMGN3Q15651 MTND4P24-201ENST00000424002 397 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
HMGN3Q15651 AL121578.1-201ENST00000428051 892 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
HMGN3Q15651 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
HMGN3Q15651 AL138830.1-201ENST00000435802 402 ntTSL 3 BASIC-0.7□□□□□ -2.52
HMGN3Q15651 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
HMGN3Q15651 RPL18AP17-201ENST00000455326 198 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
HMGN3Q15651 RNU7-159P-201ENST00000459284 62 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
HMGN3Q15651 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
HMGN3Q15651 AC109445.1-201ENST00000512356 383 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
HMGN3Q15651 LINC02358-201ENST00000514413 465 ntTSL 5 BASIC-0.7□□□□□ -2.52
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HMGN3Q15651 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
HMGN3Q15651 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
HMGN3Q15651 MIR6759-201ENST00000638110 65 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
HMGN3Q15651 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
HMGN3Q15651 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
HMGN3Q15651 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
HMGN3Q15651 AC091705.1-201ENST00000412197 209 ntTSL 5 BASIC-0.71□□□□□ -2.52
HMGN3Q15651 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
HMGN3Q15651 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
HMGN3Q15651 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
HMGN3Q15651 AF129075.1-201ENST00000457162 794 ntTSL 3 BASIC-0.71□□□□□ -2.52
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HMGN3Q15651 AC084756.1-201ENST00000558237 606 ntTSL 5 BASIC-0.71□□□□□ -2.52
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HMGN3Q15651 AC064872.1-201ENST00000604823 1072 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
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HMGN3Q15651 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
HMGN3Q15651 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
HMGN3Q15651 PPP2R2A-224ENST00000640787 318 ntTSL 5 BASIC-0.71□□□□□ -2.52
HMGN3Q15651 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
HMGN3Q15651 MIR548H2-201ENST00000408874 88 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
HMGN3Q15651 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC-0.72□□□□□ -2.52
HMGN3Q15651 AC011891.1-201ENST00000437088 432 ntTSL 3 BASIC-0.72□□□□□ -2.52
HMGN3Q15651 MTND4P15-201ENST00000437913 1033 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
HMGN3Q15651 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC-0.72□□□□□ -2.52
HMGN3Q15651 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC-0.72□□□□□ -2.52
HMGN3Q15651 MTND1P31-201ENST00000449206 961 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
HMGN3Q15651 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
HMGN3Q15651 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC-0.72□□□□□ -2.52
HMGN3Q15651 MIR4743-201ENST00000584576 69 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
HMGN3Q15651 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
HMGN3Q15651 MIR1264-201ENST00000616374 69 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
HMGN3Q15651 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
HMGN3Q15651 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
HMGN3Q15651 SNORA18.1-201ENST00000363418 128 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
HMGN3Q15651 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
HMGN3Q15651 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
HMGN3Q15651 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
HMGN3Q15651 MTCYBP39-201ENST00000437562 491 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
HMGN3Q15651 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
HMGN3Q15651 SUMO2P5-201ENST00000506790 245 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
HMGN3Q15651 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
HMGN3Q15651 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
HMGN3Q15651 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC-0.73□□□□□ -2.53
HMGN3Q15651 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC-0.73□□□□□ -2.53
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