Protein–RNA interactions for Protein: Q13901

C1D, Nuclear nucleic acid-binding protein C1D, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1DQ13901 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC0.67□□□□□ -2.3
C1DQ13901 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC0.67□□□□□ -2.3
C1DQ13901 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
C1DQ13901 AC106754.1-201ENST00000562632 1513 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
C1DQ13901 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
C1DQ13901 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
C1DQ13901 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
C1DQ13901 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
C1DQ13901 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
C1DQ13901 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
C1DQ13901 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
C1DQ13901 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
C1DQ13901 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
C1DQ13901 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
C1DQ13901 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
C1DQ13901 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
C1DQ13901 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
C1DQ13901 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
C1DQ13901 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
C1DQ13901 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
C1DQ13901 AP003461.1-201ENST00000528866 78 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
C1DQ13901 AGGF1P4-201ENST00000568249 801 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
C1DQ13901 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
C1DQ13901 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
C1DQ13901 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
C1DQ13901 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
C1DQ13901 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
C1DQ13901 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
C1DQ13901 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
C1DQ13901 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
C1DQ13901 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
C1DQ13901 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
C1DQ13901 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
C1DQ13901 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
C1DQ13901 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
C1DQ13901 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
C1DQ13901 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
C1DQ13901 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
C1DQ13901 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC0.65□□□□□ -2.31
C1DQ13901 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC0.65□□□□□ -2.31
C1DQ13901 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
C1DQ13901 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
C1DQ13901 AC100763.1-201ENST00000532735 522 ntTSL 3 BASIC0.65□□□□□ -2.31
C1DQ13901 AL049869.2-201ENST00000556634 365 ntTSL 2 BASIC0.65□□□□□ -2.31
C1DQ13901 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC0.65□□□□□ -2.31
C1DQ13901 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
C1DQ13901 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
C1DQ13901 RSL24D1P11-201ENST00000591045 491 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
C1DQ13901 AL022161.1-201ENST00000604390 213 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
C1DQ13901 AL391834.2-201ENST00000609982 546 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
C1DQ13901 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
C1DQ13901 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC0.65□□□□□ -2.31
C1DQ13901 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
C1DQ13901 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
C1DQ13901 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC0.65□□□□□ -2.31
C1DQ13901 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
C1DQ13901 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
C1DQ13901 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
C1DQ13901 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
C1DQ13901 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
C1DQ13901 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
C1DQ13901 AC011233.1-201ENST00000422812 283 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
C1DQ13901 AC003659.1-201ENST00000424251 465 ntTSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
C1DQ13901 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC0.64□□□□□ -2.31
C1DQ13901 AL356270.1-201ENST00000456587 522 ntTSL 3 BASIC0.64□□□□□ -2.31
C1DQ13901 PLSCR5-AS1-201ENST00000473817 450 ntTSL 3 BASIC0.64□□□□□ -2.31
C1DQ13901 MTND2P14-201ENST00000482139 351 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
C1DQ13901 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
C1DQ13901 MTATP6P9-201ENST00000515039 680 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
C1DQ13901 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
C1DQ13901 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
C1DQ13901 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
C1DQ13901 AC008662.2-201ENST00000522426 389 ntTSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
C1DQ13901 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC0.64□□□□□ -2.31
C1DQ13901 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
C1DQ13901 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
C1DQ13901 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
C1DQ13901 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
C1DQ13901 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
C1DQ13901 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
C1DQ13901 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
C1DQ13901 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
C1DQ13901 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
C1DQ13901 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
C1DQ13901 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
C1DQ13901 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
C1DQ13901 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
C1DQ13901 MTND3P17-201ENST00000416968 344 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
C1DQ13901 AL354692.1-201ENST00000423044 315 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
C1DQ13901 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
C1DQ13901 AL162734.1-201ENST00000432858 157 ntTSL 5 BASIC0.63□□□□□ -2.31
C1DQ13901 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
C1DQ13901 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
C1DQ13901 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
C1DQ13901 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
C1DQ13901 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
C1DQ13901 CCDC39-AS1-201ENST00000495357 283 ntTSL 3 BASIC0.63□□□□□ -2.31
C1DQ13901 AL139147.1-201ENST00000502413 1156 ntTSL 2 BASIC0.63□□□□□ -2.31
C1DQ13901 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC0.63□□□□□ -2.31
C1DQ13901 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
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