Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
ITGA9Q13797 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ITGA9Q13797 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ITGA9Q13797 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ITGA9Q13797 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ITGA9Q13797 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ITGA9Q13797 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ITGA9Q13797 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ITGA9Q13797 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ITGA9Q13797 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ITGA9Q13797 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ITGA9Q13797 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ITGA9Q13797 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ITGA9Q13797 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ITGA9Q13797 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ITGA9Q13797 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ITGA9Q13797 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ITGA9Q13797 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ITGA9Q13797 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
ITGA9Q13797 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
ITGA9Q13797 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ITGA9Q13797 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ITGA9Q13797 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ITGA9Q13797 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ITGA9Q13797 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ITGA9Q13797 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ITGA9Q13797 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ITGA9Q13797 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ITGA9Q13797 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ITGA9Q13797 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ITGA9Q13797 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ITGA9Q13797 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ITGA9Q13797 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
ITGA9Q13797 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ITGA9Q13797 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ITGA9Q13797 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ITGA9Q13797 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ITGA9Q13797 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ITGA9Q13797 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ITGA9Q13797 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ITGA9Q13797 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ITGA9Q13797 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ITGA9Q13797 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ITGA9Q13797 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
ITGA9Q13797 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
ITGA9Q13797 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
ITGA9Q13797 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
ITGA9Q13797 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ITGA9Q13797 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ITGA9Q13797 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
ITGA9Q13797 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
ITGA9Q13797 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ITGA9Q13797 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ITGA9Q13797 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ITGA9Q13797 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ITGA9Q13797 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ITGA9Q13797 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ITGA9Q13797 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ITGA9Q13797 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ITGA9Q13797 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.21□□□□□ -2.06
ITGA9Q13797 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ITGA9Q13797 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ITGA9Q13797 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ITGA9Q13797 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ITGA9Q13797 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ITGA9Q13797 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
ITGA9Q13797 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
ITGA9Q13797 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ITGA9Q13797 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ITGA9Q13797 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ITGA9Q13797 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ITGA9Q13797 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
ITGA9Q13797 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ITGA9Q13797 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ITGA9Q13797 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
ITGA9Q13797 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ITGA9Q13797 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
ITGA9Q13797 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ITGA9Q13797 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
ITGA9Q13797 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ITGA9Q13797 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ITGA9Q13797 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ITGA9Q13797 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ITGA9Q13797 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ITGA9Q13797 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ITGA9Q13797 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
ITGA9Q13797 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
ITGA9Q13797 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
ITGA9Q13797 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
ITGA9Q13797 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ITGA9Q13797 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ITGA9Q13797 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ITGA9Q13797 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ITGA9Q13797 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ITGA9Q13797 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ITGA9Q13797 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
ITGA9Q13797 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ITGA9Q13797 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ITGA9Q13797 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
ITGA9Q13797 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 498.9 ms