Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CBX3Q13185 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CBX3Q13185 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CBX3Q13185 AC004930.1-201ENST00000470677 254 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CBX3Q13185 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CBX3Q13185 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CBX3Q13185 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CBX3Q13185 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CBX3Q13185 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CBX3Q13185 NBR2-204ENST00000587322 63 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CBX3Q13185 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CBX3Q13185 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CBX3Q13185 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CBX3Q13185 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CBX3Q13185 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CBX3Q13185 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CBX3Q13185 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CBX3Q13185 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CBX3Q13185 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CBX3Q13185 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CBX3Q13185 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CBX3Q13185 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CBX3Q13185 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CBX3Q13185 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CBX3Q13185 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CBX3Q13185 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CBX3Q13185 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CBX3Q13185 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CBX3Q13185 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CBX3Q13185 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
CBX3Q13185 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CBX3Q13185 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CBX3Q13185 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CBX3Q13185 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CBX3Q13185 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CBX3Q13185 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CBX3Q13185 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CBX3Q13185 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CBX3Q13185 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CBX3Q13185 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CBX3Q13185 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CBX3Q13185 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CBX3Q13185 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CBX3Q13185 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CBX3Q13185 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CBX3Q13185 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
CBX3Q13185 MTND1P29-201ENST00000448112 647 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CBX3Q13185 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CBX3Q13185 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CBX3Q13185 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CBX3Q13185 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CBX3Q13185 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CBX3Q13185 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CBX3Q13185 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CBX3Q13185 PIGPP4-201ENST00000584447 307 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CBX3Q13185 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CBX3Q13185 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CBX3Q13185 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CBX3Q13185 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CBX3Q13185 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CBX3Q13185 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CBX3Q13185 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CBX3Q13185 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CBX3Q13185 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CBX3Q13185 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CBX3Q13185 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CBX3Q13185 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CBX3Q13185 AL096799.1-201ENST00000425900 381 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CBX3Q13185 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CBX3Q13185 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CBX3Q13185 LINC00907-210ENST00000593316 847 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CBX3Q13185 AC146944.4-201ENST00000602697 718 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CBX3Q13185 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CBX3Q13185 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CBX3Q13185 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CBX3Q13185 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CBX3Q13185 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CBX3Q13185 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CBX3Q13185 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CBX3Q13185 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CBX3Q13185 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CBX3Q13185 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CBX3Q13185 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CBX3Q13185 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CBX3Q13185 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CBX3Q13185 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CBX3Q13185 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CBX3Q13185 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CBX3Q13185 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CBX3Q13185 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CBX3Q13185 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CBX3Q13185 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CBX3Q13185 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CBX3Q13185 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CBX3Q13185 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
CBX3Q13185 AL606534.3-201ENST00000437499 373 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
CBX3Q13185 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CBX3Q13185 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CBX3Q13185 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CBX3Q13185 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC1.53□□□□□ -2.16
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