Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 AL139147.1-201ENST00000502413 1156 ntTSL 2 BASIC0.82□□□□□ -2.28
TTPAP49638 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
TTPAP49638 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
TTPAP49638 AC106038.2-201ENST00000520706 568 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
TTPAP49638 AC078880.1-201ENST00000546696 553 ntTSL 4 BASIC0.82□□□□□ -2.28
TTPAP49638 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC0.82□□□□□ -2.28
TTPAP49638 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC0.82□□□□□ -2.28
TTPAP49638 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
TTPAP49638 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
TTPAP49638 AC090616.2-202ENST00000584248 222 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
TTPAP49638 AC245884.10-201ENST00000597355 337 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
TTPAP49638 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
TTPAP49638 AP001506.1-201ENST00000615444 211 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
TTPAP49638 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
TTPAP49638 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC0.82□□□□□ -2.28
TTPAP49638 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.81□□□□□ -2.28
TTPAP49638 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TTPAP49638 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TTPAP49638 MTCO2P34-201ENST00000421994 607 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TTPAP49638 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC0.81□□□□□ -2.28
TTPAP49638 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC0.81□□□□□ -2.28
TTPAP49638 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TTPAP49638 LINC02064-202ENST00000507876 403 ntTSL 5 BASIC0.81□□□□□ -2.28
TTPAP49638 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC0.81□□□□□ -2.28
TTPAP49638 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TTPAP49638 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TTPAP49638 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TTPAP49638 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TTPAP49638 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TTPAP49638 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TTPAP49638 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TTPAP49638 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.8□□□□□ -2.28
TTPAP49638 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.8□□□□□ -2.28
TTPAP49638 MT-ND2-201ENST00000361453 1042 ntAPPRIS P1 BASIC0.8□□□□□ -2.28
TTPAP49638 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TTPAP49638 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TTPAP49638 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TTPAP49638 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TTPAP49638 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC0.8□□□□□ -2.28
TTPAP49638 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC0.8□□□□□ -2.28
TTPAP49638 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC0.8□□□□□ -2.28
TTPAP49638 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC0.8□□□□□ -2.28
TTPAP49638 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TTPAP49638 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC0.8□□□□□ -2.28
TTPAP49638 RNU6-1129P-201ENST00000515964 104 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TTPAP49638 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
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TTPAP49638 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TTPAP49638 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TTPAP49638 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TTPAP49638 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC0.8□□□□□ -2.28
TTPAP49638 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC0.8□□□□□ -2.28
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TTPAP49638 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TTPAP49638 AC005304.3-201ENST00000581533 511 ntTSL 3 BASIC0.8□□□□□ -2.28
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TTPAP49638 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
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TTPAP49638 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
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TTPAP49638 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.79□□□□□ -2.28
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TTPAP49638 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
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TTPAP49638 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
TTPAP49638 RNU7-125P-201ENST00000458760 62 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
TTPAP49638 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
TTPAP49638 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
TTPAP49638 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
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TTPAP49638 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
TTPAP49638 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TTPAP49638 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TTPAP49638 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TTPAP49638 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.78□□□□□ -2.28
TTPAP49638 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC0.78□□□□□ -2.28
TTPAP49638 AC010099.3-201ENST00000423896 409 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TTPAP49638 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TTPAP49638 CETN4P-201ENST00000432407 469 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TTPAP49638 AC008568.1-203ENST00000433406 765 ntTSL 3 BASIC0.78□□□□□ -2.28
TTPAP49638 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TTPAP49638 AL136537.1-201ENST00000508199 538 ntTSL 3 BASIC0.78□□□□□ -2.28
TTPAP49638 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TTPAP49638 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TTPAP49638 AP002963.1-201ENST00000530590 184 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TTPAP49638 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC0.78□□□□□ -2.28
TTPAP49638 AC008015.1-201ENST00000555505 465 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TTPAP49638 LINC01491-201ENST00000558434 505 ntTSL 3 BASIC0.78□□□□□ -2.28
TTPAP49638 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
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