Protein–RNA interactions for Protein: J3KRW8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

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Length 73 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KRW8 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
J3KRW8 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
J3KRW8 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
J3KRW8 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
J3KRW8 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
J3KRW8 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
J3KRW8 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
J3KRW8 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
J3KRW8 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
J3KRW8 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
J3KRW8 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
J3KRW8 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
J3KRW8 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
J3KRW8 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
J3KRW8 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
J3KRW8 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
J3KRW8 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
J3KRW8 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
J3KRW8 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
J3KRW8 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
J3KRW8 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
J3KRW8 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
J3KRW8 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
J3KRW8 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
J3KRW8 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
J3KRW8 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
J3KRW8 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
J3KRW8 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.07□□□□□ -2.08
J3KRW8 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
J3KRW8 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
J3KRW8 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
J3KRW8 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
J3KRW8 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
J3KRW8 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
J3KRW8 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
J3KRW8 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
J3KRW8 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
J3KRW8 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
J3KRW8 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
J3KRW8 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
J3KRW8 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
J3KRW8 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
J3KRW8 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
J3KRW8 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
J3KRW8 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
J3KRW8 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
J3KRW8 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
J3KRW8 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
J3KRW8 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
J3KRW8 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
J3KRW8 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
J3KRW8 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
J3KRW8 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
J3KRW8 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
J3KRW8 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
J3KRW8 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
J3KRW8 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
J3KRW8 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
J3KRW8 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
J3KRW8 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
J3KRW8 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
J3KRW8 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
J3KRW8 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
J3KRW8 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
J3KRW8 AC008549.1-201ENST00000512900 643 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
J3KRW8 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
J3KRW8 AC096558.1-203ENST00000550516 574 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
J3KRW8 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
J3KRW8 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
J3KRW8 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
J3KRW8 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
J3KRW8 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
J3KRW8 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
J3KRW8 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
J3KRW8 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
J3KRW8 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.06□□□□□ -2.08
J3KRW8 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
J3KRW8 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
J3KRW8 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
J3KRW8 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
J3KRW8 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
J3KRW8 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
J3KRW8 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
J3KRW8 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
J3KRW8 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
J3KRW8 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
J3KRW8 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
J3KRW8 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
J3KRW8 MTND3P10-201ENST00000450967 341 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
J3KRW8 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
J3KRW8 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
J3KRW8 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
J3KRW8 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
J3KRW8 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
J3KRW8 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
J3KRW8 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
J3KRW8 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
J3KRW8 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
J3KRW8 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
J3KRW8 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
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