Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 AC025917.1-202ENST00000566344 635 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
CCDC47Q96A33 AC087683.1-201ENST00000591187 441 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CCDC47Q96A33 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CCDC47Q96A33 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CCDC47Q96A33 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
CCDC47Q96A33 AP000770.2-201ENST00000623694 100 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CCDC47Q96A33 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CCDC47Q96A33 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CCDC47Q96A33 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CCDC47Q96A33 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CCDC47Q96A33 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CCDC47Q96A33 AC000123.1-201ENST00000418215 516 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
CCDC47Q96A33 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CCDC47Q96A33 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
CCDC47Q96A33 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CCDC47Q96A33 RPS3AP17-201ENST00000472594 777 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CCDC47Q96A33 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CCDC47Q96A33 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CCDC47Q96A33 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
CCDC47Q96A33 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CCDC47Q96A33 AC008088.1-201ENST00000580993 280 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CCDC47Q96A33 AC008147.4-201ENST00000617570 1204 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CCDC47Q96A33 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
CCDC47Q96A33 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
CCDC47Q96A33 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
CCDC47Q96A33 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CCDC47Q96A33 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CCDC47Q96A33 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CCDC47Q96A33 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CCDC47Q96A33 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CCDC47Q96A33 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CCDC47Q96A33 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CCDC47Q96A33 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CCDC47Q96A33 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CCDC47Q96A33 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CCDC47Q96A33 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CCDC47Q96A33 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
CCDC47Q96A33 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CCDC47Q96A33 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CCDC47Q96A33 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CCDC47Q96A33 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CCDC47Q96A33 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CCDC47Q96A33 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CCDC47Q96A33 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CCDC47Q96A33 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CCDC47Q96A33 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CCDC47Q96A33 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CCDC47Q96A33 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CCDC47Q96A33 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CCDC47Q96A33 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CCDC47Q96A33 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CCDC47Q96A33 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CCDC47Q96A33 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CCDC47Q96A33 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CCDC47Q96A33 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CCDC47Q96A33 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CCDC47Q96A33 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CCDC47Q96A33 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CCDC47Q96A33 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CCDC47Q96A33 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CCDC47Q96A33 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CCDC47Q96A33 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CCDC47Q96A33 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CCDC47Q96A33 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CCDC47Q96A33 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CCDC47Q96A33 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CCDC47Q96A33 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CCDC47Q96A33 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CCDC47Q96A33 AL355314.1-201ENST00000453639 316 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CCDC47Q96A33 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CCDC47Q96A33 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CCDC47Q96A33 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CCDC47Q96A33 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CCDC47Q96A33 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CCDC47Q96A33 AC007834.2-201ENST00000536310 343 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CCDC47Q96A33 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CCDC47Q96A33 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CCDC47Q96A33 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CCDC47Q96A33 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CCDC47Q96A33 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CCDC47Q96A33 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CCDC47Q96A33 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CCDC47Q96A33 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CCDC47Q96A33 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CCDC47Q96A33 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CCDC47Q96A33 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CCDC47Q96A33 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CCDC47Q96A33 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CCDC47Q96A33 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CCDC47Q96A33 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CCDC47Q96A33 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CCDC47Q96A33 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CCDC47Q96A33 AC078883.4-201ENST00000623218 367 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CCDC47Q96A33 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CCDC47Q96A33 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CCDC47Q96A33 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CCDC47Q96A33 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CCDC47Q96A33 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CCDC47Q96A33 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CCDC47Q96A33 AL663109.1-201ENST00000411498 844 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
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