Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC-0.61□□□□□ -2.51
HMGN3Q15651 AC079917.1-202ENST00000534059 625 ntTSL 3 BASIC-0.61□□□□□ -2.51
HMGN3Q15651 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
HMGN3Q15651 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC-0.61□□□□□ -2.51
HMGN3Q15651 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
HMGN3Q15651 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
HMGN3Q15651 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
HMGN3Q15651 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
HMGN3Q15651 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
HMGN3Q15651 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
HMGN3Q15651 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
HMGN3Q15651 MTCO3P43-201ENST00000440974 771 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
HMGN3Q15651 MRPL42P4-201ENST00000453267 443 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
HMGN3Q15651 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC-0.62□□□□□ -2.51
HMGN3Q15651 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
HMGN3Q15651 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
HMGN3Q15651 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
HMGN3Q15651 AC087276.4-201ENST00000530042 444 ntTSL 3 BASIC-0.62□□□□□ -2.51
HMGN3Q15651 HTN3-205ENST00000530128 775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC-0.62□□□□□ -2.51
HMGN3Q15651 AC098850.3-201ENST00000577569 771 ntTSL 3 BASIC-0.62□□□□□ -2.51
HMGN3Q15651 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
HMGN3Q15651 RSL24D1P11-201ENST00000591045 491 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
HMGN3Q15651 AC104073.3-201ENST00000610942 955 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
HMGN3Q15651 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
HMGN3Q15651 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
HMGN3Q15651 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
HMGN3Q15651 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
HMGN3Q15651 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC-0.63□□□□□ -2.51
HMGN3Q15651 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
HMGN3Q15651 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
HMGN3Q15651 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC-0.63□□□□□ -2.51
HMGN3Q15651 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
HMGN3Q15651 AP001189.2-201ENST00000527320 189 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
HMGN3Q15651 AHI1-212ENST00000528103 441 ntTSL 1 (best) BASIC-0.63□□□□□ -2.51
HMGN3Q15651 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
HMGN3Q15651 AL121904.1-201ENST00000611894 948 ntTSL 5 BASIC-0.63□□□□□ -2.51
HMGN3Q15651 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC-0.63□□□□□ -2.51
HMGN3Q15651 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
HMGN3Q15651 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
HMGN3Q15651 MIR106A-201ENST00000384870 81 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
HMGN3Q15651 RNU6-127P-201ENST00000390897 107 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
HMGN3Q15651 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
HMGN3Q15651 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC-0.64□□□□□ -2.51
HMGN3Q15651 MTCO1P57-201ENST00000432182 261 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
HMGN3Q15651 OFD1P4Y-201ENST00000455273 1179 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
HMGN3Q15651 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
HMGN3Q15651 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
HMGN3Q15651 MTND1P36-201ENST00000522384 936 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
HMGN3Q15651 ZNF321P-202ENST00000550843 495 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
HMGN3Q15651 AL158211.1-201ENST00000566763 763 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
HMGN3Q15651 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
HMGN3Q15651 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
HMGN3Q15651 AP001033.2-201ENST00000609701 1003 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
HMGN3Q15651 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
HMGN3Q15651 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC-0.65□□□□□ -2.51
HMGN3Q15651 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.65□□□□□ -2.51
HMGN3Q15651 RNU6-216P-201ENST00000363282 104 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
HMGN3Q15651 SNORD56.4-201ENST00000363883 71 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
HMGN3Q15651 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
HMGN3Q15651 SNORD115-48-201ENST00000364764 76 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
HMGN3Q15651 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
HMGN3Q15651 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
HMGN3Q15651 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
HMGN3Q15651 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
HMGN3Q15651 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
HMGN3Q15651 AC019070.1-201ENST00000415008 1024 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
HMGN3Q15651 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
HMGN3Q15651 MTND3P5-201ENST00000512798 333 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
HMGN3Q15651 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC-0.65□□□□□ -2.51
HMGN3Q15651 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
HMGN3Q15651 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
HMGN3Q15651 AC105185.1-201ENST00000518705 535 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
HMGN3Q15651 IGLVI-20-201ENST00000519296 130 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
HMGN3Q15651 MIR4645-201ENST00000583158 77 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
HMGN3Q15651 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
HMGN3Q15651 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
HMGN3Q15651 AP000568.1-201ENST00000282964 442 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
HMGN3Q15651 RNA5SP275-201ENST00000363936 118 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
HMGN3Q15651 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
HMGN3Q15651 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
HMGN3Q15651 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC-0.66□□□□□ -2.52
HMGN3Q15651 MTND2P6-201ENST00000455337 1030 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
HMGN3Q15651 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC-0.66□□□□□ -2.52
HMGN3Q15651 RNU7-136P-201ENST00000458819 69 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
HMGN3Q15651 CCNG1-203ENST00000504553 732 ntTSL 3 BASIC-0.66□□□□□ -2.52
HMGN3Q15651 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
HMGN3Q15651 AC025917.1-202ENST00000566344 635 ntTSL 5 BASIC-0.66□□□□□ -2.52
HMGN3Q15651 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
HMGN3Q15651 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
HMGN3Q15651 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.66□□□□□ -2.52
HMGN3Q15651 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
HMGN3Q15651 RNU6-353P-201ENST00000364266 108 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
HMGN3Q15651 SNORD114-12-201ENST00000365400 75 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
HMGN3Q15651 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
HMGN3Q15651 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
HMGN3Q15651 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
HMGN3Q15651 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
HMGN3Q15651 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
HMGN3Q15651 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
HMGN3Q15651 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
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