Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
HOXD10P28358 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 AC073869.6-201ENST00000640656 341 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC1.76□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC1.76□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 AC146944.4-201ENST00000602697 718 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 LINC01691-201ENST00000450546 426 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
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