Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
LINC00587B1AMM8 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
LINC00587B1AMM8 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC-0.58□□□□□ -2.5
LINC00587B1AMM8 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
LINC00587B1AMM8 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC-0.58□□□□□ -2.5
LINC00587B1AMM8 AL513412.1-201ENST00000445708 553 ntTSL 4 BASIC-0.58□□□□□ -2.5
LINC00587B1AMM8 DPP10-AS2-201ENST00000446992 624 ntTSL 5 BASIC-0.58□□□□□ -2.5
LINC00587B1AMM8 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
LINC00587B1AMM8 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC-0.58□□□□□ -2.5
LINC00587B1AMM8 RNU6-320P-201ENST00000516511 106 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
LINC00587B1AMM8 HTN3-205ENST00000530128 775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC-0.58□□□□□ -2.5
LINC00587B1AMM8 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
LINC00587B1AMM8 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
LINC00587B1AMM8 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
LINC00587B1AMM8 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
LINC00587B1AMM8 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
LINC00587B1AMM8 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
LINC00587B1AMM8 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
LINC00587B1AMM8 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
LINC00587B1AMM8 AL603865.2-201ENST00000401679 213 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
LINC00587B1AMM8 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
LINC00587B1AMM8 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
LINC00587B1AMM8 TMEM212-IT1-201ENST00000456146 470 ntTSL 3 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
LINC00587B1AMM8 RPS3AP17-201ENST00000472594 777 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
LINC00587B1AMM8 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
LINC00587B1AMM8 VCAN-AS1-201ENST00000512090 424 ntTSL 3 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
LINC00587B1AMM8 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
LINC00587B1AMM8 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
LINC00587B1AMM8 OR8K2P-201ENST00000524645 927 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
LINC00587B1AMM8 AC087276.4-201ENST00000530042 444 ntTSL 3 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
LINC00587B1AMM8 AC084756.1-201ENST00000558237 606 ntTSL 5 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
LINC00587B1AMM8 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
LINC00587B1AMM8 MIR4743-201ENST00000584576 69 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
LINC00587B1AMM8 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
LINC00587B1AMM8 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
LINC00587B1AMM8 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
LINC00587B1AMM8 MIR643-201ENST00000385267 97 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
LINC00587B1AMM8 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
LINC00587B1AMM8 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC-0.6□□□□□ -2.51
LINC00587B1AMM8 LINC00446-202ENST00000438327 357 ntTSL 3 BASIC-0.6□□□□□ -2.51
LINC00587B1AMM8 AL662889.1-201ENST00000453572 389 ntTSL 3 BASIC-0.6□□□□□ -2.51
LINC00587B1AMM8 RPL18AP17-201ENST00000455326 198 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
LINC00587B1AMM8 AC112206.4-201ENST00000515142 405 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
LINC00587B1AMM8 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
LINC00587B1AMM8 LRRC6P1-201ENST00000532188 885 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
LINC00587B1AMM8 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
LINC00587B1AMM8 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
LINC00587B1AMM8 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
LINC00587B1AMM8 AC231657.1-201ENST00000624313 397 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
LINC00587B1AMM8 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC-0.61□□□□□ -2.51
LINC00587B1AMM8 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.61□□□□□ -2.51
LINC00587B1AMM8 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC-0.61□□□□□ -2.51
LINC00587B1AMM8 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
LINC00587B1AMM8 SEPT14P24-201ENST00000447236 180 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
LINC00587B1AMM8 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
LINC00587B1AMM8 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
LINC00587B1AMM8 RN7SKP287-201ENST00000516546 266 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
LINC00587B1AMM8 DEFB108A-201ENST00000530110 222 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
LINC00587B1AMM8 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
LINC00587B1AMM8 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
LINC00587B1AMM8 AC064872.1-201ENST00000604823 1072 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
LINC00587B1AMM8 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
LINC00587B1AMM8 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
LINC00587B1AMM8 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
LINC00587B1AMM8 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
LINC00587B1AMM8 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
LINC00587B1AMM8 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC-0.62□□□□□ -2.51
LINC00587B1AMM8 GXYLT1P1-201ENST00000446657 490 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
LINC00587B1AMM8 AL355997.1-202ENST00000454361 610 ntTSL 3 BASIC-0.62□□□□□ -2.51
LINC00587B1AMM8 TMF1P1-201ENST00000576058 373 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
LINC00587B1AMM8 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
LINC00587B1AMM8 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
LINC00587B1AMM8 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
LINC00587B1AMM8 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
LINC00587B1AMM8 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
LINC00587B1AMM8 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
LINC00587B1AMM8 MIR106A-201ENST00000384870 81 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
LINC00587B1AMM8 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
LINC00587B1AMM8 AL354692.1-201ENST00000423044 315 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
LINC00587B1AMM8 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC-0.63□□□□□ -2.51
LINC00587B1AMM8 GJE1-201ENST00000450456 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.63□□□□□ -2.51
LINC00587B1AMM8 ZNF886P-201ENST00000450781 723 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
LINC00587B1AMM8 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
LINC00587B1AMM8 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC-0.63□□□□□ -2.51
LINC00587B1AMM8 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
LINC00587B1AMM8 AC090186.1-201ENST00000605991 572 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
LINC00587B1AMM8 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
LINC00587B1AMM8 AC124016.2-201ENST00000610058 665 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
LINC00587B1AMM8 AC099654.8-201ENST00000637757 681 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
LINC00587B1AMM8 AC006927.4-201ENST00000639187 543 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
LINC00587B1AMM8 RNU5B-1-201ENST00000363286 116 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
LINC00587B1AMM8 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
LINC00587B1AMM8 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
LINC00587B1AMM8 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
LINC00587B1AMM8 AL512656.1-201ENST00000427492 401 ntTSL 2 BASIC-0.64□□□□□ -2.51
LINC00587B1AMM8 MTCO1P3-201ENST00000429327 192 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
LINC00587B1AMM8 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC-0.64□□□□□ -2.51
LINC00587B1AMM8 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
LINC00587B1AMM8 AC026414.1-201ENST00000504046 698 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
LINC00587B1AMM8 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.6 ms