Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
GEN1Q17RS7 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.9 ms