Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SIX1Q15475 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SIX1Q15475 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SIX1Q15475 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SIX1Q15475 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SIX1Q15475 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SIX1Q15475 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SIX1Q15475 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SIX1Q15475 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SIX1Q15475 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SIX1Q15475 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SIX1Q15475 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SIX1Q15475 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SIX1Q15475 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SIX1Q15475 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
SIX1Q15475 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SIX1Q15475 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SIX1Q15475 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SIX1Q15475 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SIX1Q15475 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SIX1Q15475 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SIX1Q15475 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SIX1Q15475 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SIX1Q15475 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SIX1Q15475 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SIX1Q15475 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SIX1Q15475 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SIX1Q15475 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SIX1Q15475 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SIX1Q15475 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SIX1Q15475 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SIX1Q15475 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SIX1Q15475 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SIX1Q15475 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SIX1Q15475 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SIX1Q15475 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SIX1Q15475 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SIX1Q15475 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
SIX1Q15475 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SIX1Q15475 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SIX1Q15475 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SIX1Q15475 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SIX1Q15475 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SIX1Q15475 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SIX1Q15475 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SIX1Q15475 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
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SIX1Q15475 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
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SIX1Q15475 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
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SIX1Q15475 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
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SIX1Q15475 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
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SIX1Q15475 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SIX1Q15475 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
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SIX1Q15475 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
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SIX1Q15475 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SIX1Q15475 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SIX1Q15475 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SIX1Q15475 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SIX1Q15475 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SIX1Q15475 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
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SIX1Q15475 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
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SIX1Q15475 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SIX1Q15475 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SIX1Q15475 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SIX1Q15475 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SIX1Q15475 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SIX1Q15475 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
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SIX1Q15475 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SIX1Q15475 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SIX1Q15475 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
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