Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 AC122108.2-201ENST00000611946 526 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.91□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
MSLNQ13421 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 Y_RNA.619-201ENST00000410951 90 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 AL049869.2-201ENST00000556634 365 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 FCF1P9-201ENST00000412546 282 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC1.89□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 AC025917.1-202ENST00000566344 635 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 AP003465.2-201ENST00000602571 373 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
MSLNQ13421 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
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