Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 ITCH-IT1-201ENST00000418598 208 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 MAPK10-373ENST00000641983 6772 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 FAM35A-202ENST00000298786 3614 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 DST-201ENST00000244364 16742 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 PRKACB-208ENST00000394839 4200 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 MUC19-205ENST00000454784 24775 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 ADGRG2-205ENST00000357991 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 RNA5SP366-201ENST00000365454 123 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 ARPP21-211ENST00000427542 568 ntTSL 4 BASIC4.09□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 AL645939.1-201ENST00000453429 797 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 RN7SL132P-201ENST00000478131 296 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 RNA5SP143-201ENST00000516936 115 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 MIR2116-201ENST00000517221 80 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC4.09□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 AC020914.4-201ENST00000597690 277 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 MIR3653-201ENST00000625572 110 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 ZNF705E-201ENST00000525199 3442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
HIF1AQ16665 MIR383-201ENST00000362257 73 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
HIF1AQ16665 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
HIF1AQ16665 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
HIF1AQ16665 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
HIF1AQ16665 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
HIF1AQ16665 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
HIF1AQ16665 CFAP44-202ENST00000393845 7069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
HIF1AQ16665 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
HIF1AQ16665 AC018462.1-201ENST00000425966 1684 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
HIF1AQ16665 AL500522.2-201ENST00000448562 343 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
HIF1AQ16665 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
HIF1AQ16665 RN7SL604P-201ENST00000492589 296 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
HIF1AQ16665 AC114741.1-201ENST00000504357 464 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
HIF1AQ16665 AP003730.1-201ENST00000524605 285 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
HIF1AQ16665 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
HIF1AQ16665 PREPL-206ENST00000409936 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
HIF1AQ16665 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
HIF1AQ16665 OR1C1-202ENST00000641256 3719 ntAPPRIS P1 BASIC4.07□□□□□ -1.76
HIF1AQ16665 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
HIF1AQ16665 OR6P1-202ENST00000641540 3255 ntAPPRIS P1 BASIC4.07□□□□□ -1.76
HIF1AQ16665 NKTR-219ENST00000617821 7319 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
HIF1AQ16665 WNK3-202ENST00000375159 5403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
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HIF1AQ16665 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
HIF1AQ16665 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
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HIF1AQ16665 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
HIF1AQ16665 RNU6ATAC34P-201ENST00000408879 121 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
HIF1AQ16665 AL691449.1-201ENST00000426570 421 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
HIF1AQ16665 AL445584.1-201ENST00000431451 330 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
HIF1AQ16665 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
HIF1AQ16665 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
HIF1AQ16665 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
HIF1AQ16665 AC106785.1-201ENST00000565935 262 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
HIF1AQ16665 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
HIF1AQ16665 AC006133.1-201ENST00000617106 264 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
HIF1AQ16665 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
HIF1AQ16665 PTPN22-202ENST00000420377 2726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
HIF1AQ16665 AC010186.3-201ENST00000537616 2508 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
HIF1AQ16665 KIAA1107-203ENST00000637221 4337 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
HIF1AQ16665 CDH10-201ENST00000264463 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
HIF1AQ16665 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
HIF1AQ16665 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
HIF1AQ16665 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
HIF1AQ16665 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
HIF1AQ16665 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
HIF1AQ16665 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
HIF1AQ16665 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
HIF1AQ16665 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
HIF1AQ16665 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
HIF1AQ16665 RNA5SP315-201ENST00000516340 116 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
HIF1AQ16665 RNA5SP312-201ENST00000517068 116 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
HIF1AQ16665 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
HIF1AQ16665 AC113192.1-201ENST00000527270 321 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
HIF1AQ16665 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
HIF1AQ16665 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
HIF1AQ16665 ANO3-204ENST00000531568 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
HIF1AQ16665 SLC6A15-203ENST00000450363 4229 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
HIF1AQ16665 GCSAML-203ENST00000366491 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
HIF1AQ16665 TRMT10A-203ENST00000394877 3516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
HIF1AQ16665 SENP7-202ENST00000348610 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
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