Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 AC009313.1-201ENST00000425470 503 ntTSL 3 BASIC-0.45□□□□□ -2.48
HMGN3Q15651 AC002486.1-201ENST00000435098 391 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
HMGN3Q15651 ART2BP-201ENST00000453501 499 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
HMGN3Q15651 MTND1P9-201ENST00000453775 944 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
HMGN3Q15651 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC-0.45□□□□□ -2.48
HMGN3Q15651 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
HMGN3Q15651 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC-0.45□□□□□ -2.48
HMGN3Q15651 MTND4LP26-201ENST00000518144 282 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
HMGN3Q15651 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
HMGN3Q15651 LINC01578-206ENST00000555520 977 ntTSL 3 BASIC-0.45□□□□□ -2.48
HMGN3Q15651 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
HMGN3Q15651 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
HMGN3Q15651 AL078595.3-201ENST00000623815 1166 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
HMGN3Q15651 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
HMGN3Q15651 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
HMGN3Q15651 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
HMGN3Q15651 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
HMGN3Q15651 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
HMGN3Q15651 MIR214-201ENST00000385214 110 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
HMGN3Q15651 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
HMGN3Q15651 VPS26BP1-201ENST00000417155 755 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
HMGN3Q15651 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
HMGN3Q15651 AC092427.1-201ENST00000439177 601 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
HMGN3Q15651 LINC02462-201ENST00000503009 430 ntTSL 5 BASIC-0.46□□□□□ -2.48
HMGN3Q15651 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
HMGN3Q15651 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC-0.46□□□□□ -2.48
HMGN3Q15651 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC-0.46□□□□□ -2.48
HMGN3Q15651 LINC02311-201ENST00000556144 383 ntTSL 3 BASIC-0.46□□□□□ -2.48
HMGN3Q15651 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
HMGN3Q15651 RNU6-302P-201ENST00000365249 107 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
HMGN3Q15651 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
HMGN3Q15651 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
HMGN3Q15651 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
HMGN3Q15651 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC-0.47□□□□□ -2.48
HMGN3Q15651 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
HMGN3Q15651 GJE1-201ENST00000450456 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.47□□□□□ -2.48
HMGN3Q15651 AL157400.4-201ENST00000455699 667 ntTSL 1 (best) BASIC-0.47□□□□□ -2.48
HMGN3Q15651 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
HMGN3Q15651 AC091860.1-201ENST00000505723 432 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
HMGN3Q15651 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC-0.47□□□□□ -2.48
HMGN3Q15651 AC116347.2-201ENST00000514912 523 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
HMGN3Q15651 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
HMGN3Q15651 AC133794.1-201ENST00000602731 914 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
HMGN3Q15651 MIR1322-201ENST00000638013 71 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
HMGN3Q15651 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
HMGN3Q15651 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
HMGN3Q15651 SNORA27.3-201ENST00000364937 134 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
HMGN3Q15651 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
HMGN3Q15651 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
HMGN3Q15651 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
HMGN3Q15651 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
HMGN3Q15651 AC027644.1-201ENST00000419595 298 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
HMGN3Q15651 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC-0.48□□□□□ -2.49
HMGN3Q15651 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
HMGN3Q15651 MTCO2P18-201ENST00000457151 658 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
HMGN3Q15651 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
HMGN3Q15651 BLNK-209ENST00000495266 440 ntTSL 5 BASIC-0.48□□□□□ -2.49
HMGN3Q15651 AC093292.1-201ENST00000505050 449 ntTSL 3 BASIC-0.48□□□□□ -2.49
HMGN3Q15651 LINC02201-201ENST00000508992 468 ntTSL 2 BASIC-0.48□□□□□ -2.49
HMGN3Q15651 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC-0.48□□□□□ -2.49
HMGN3Q15651 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
HMGN3Q15651 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
HMGN3Q15651 RNU6-1066P-201ENST00000363573 105 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
HMGN3Q15651 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
HMGN3Q15651 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
HMGN3Q15651 MTCYBP5-201ENST00000423752 1135 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
HMGN3Q15651 DPRXP1-201ENST00000426312 460 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
HMGN3Q15651 EEF1A1P39-201ENST00000440791 250 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
HMGN3Q15651 AL133217.1-201ENST00000450980 425 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
HMGN3Q15651 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC-0.49□□□□□ -2.49
HMGN3Q15651 AL122001.1-201ENST00000457027 370 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
HMGN3Q15651 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC-0.49□□□□□ -2.49
HMGN3Q15651 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC-0.49□□□□□ -2.49
HMGN3Q15651 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC-0.49□□□□□ -2.49
HMGN3Q15651 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
HMGN3Q15651 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
HMGN3Q15651 AP003049.1-201ENST00000529418 457 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
HMGN3Q15651 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
HMGN3Q15651 AC090948.3-201ENST00000606713 551 ntTSL 4 BASIC-0.49□□□□□ -2.49
HMGN3Q15651 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
HMGN3Q15651 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
HMGN3Q15651 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
HMGN3Q15651 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
HMGN3Q15651 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
HMGN3Q15651 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC-0.5□□□□□ -2.49
HMGN3Q15651 AC002542.1-201ENST00000440683 193 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
HMGN3Q15651 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC-0.5□□□□□ -2.49
HMGN3Q15651 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
HMGN3Q15651 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
HMGN3Q15651 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC-0.5□□□□□ -2.49
HMGN3Q15651 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC-0.5□□□□□ -2.49
HMGN3Q15651 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
HMGN3Q15651 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC-0.5□□□□□ -2.49
HMGN3Q15651 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
HMGN3Q15651 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC-0.5□□□□□ -2.49
HMGN3Q15651 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
HMGN3Q15651 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
HMGN3Q15651 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
HMGN3Q15651 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
HMGN3Q15651 ZNF736P9Y-201ENST00000439586 1345 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
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