Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 178 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 AC091059.1-201ENST00000585190 215 ntTSL 3 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
APOC4-APOC2K7ER74 AC008764.5-201ENST00000597851 190 ntTSL 5 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
APOC4-APOC2K7ER74 AC097065.2-201ENST00000608159 533 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
APOC4-APOC2K7ER74 AC104073.3-201ENST00000610942 955 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
APOC4-APOC2K7ER74 AC007527.2-201ENST00000621825 546 ntTSL 5 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
APOC4-APOC2K7ER74 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
APOC4-APOC2K7ER74 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
APOC4-APOC2K7ER74 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
APOC4-APOC2K7ER74 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC-0.06□□□□□ -2.42
APOC4-APOC2K7ER74 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
APOC4-APOC2K7ER74 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC-0.06□□□□□ -2.42
APOC4-APOC2K7ER74 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.06□□□□□ -2.42
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APOC4-APOC2K7ER74 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
APOC4-APOC2K7ER74 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
APOC4-APOC2K7ER74 AL603865.2-201ENST00000401679 213 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
APOC4-APOC2K7ER74 AP001136.1-201ENST00000425058 635 ntTSL 2 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
APOC4-APOC2K7ER74 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
APOC4-APOC2K7ER74 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
APOC4-APOC2K7ER74 AC093292.1-201ENST00000505050 449 ntTSL 3 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
APOC4-APOC2K7ER74 MTND3P5-201ENST00000512798 333 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
APOC4-APOC2K7ER74 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
APOC4-APOC2K7ER74 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
APOC4-APOC2K7ER74 LINC02290-203ENST00000556662 577 ntTSL 4 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
APOC4-APOC2K7ER74 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
APOC4-APOC2K7ER74 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
APOC4-APOC2K7ER74 AC104072.1-201ENST00000568817 668 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
APOC4-APOC2K7ER74 AL445435.1-201ENST00000604232 665 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
APOC4-APOC2K7ER74 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
APOC4-APOC2K7ER74 AC124016.2-201ENST00000610058 665 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
APOC4-APOC2K7ER74 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
APOC4-APOC2K7ER74 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
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APOC4-APOC2K7ER74 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.09□□□□□ -2.42
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APOC4-APOC2K7ER74 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
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APOC4-APOC2K7ER74 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
APOC4-APOC2K7ER74 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
APOC4-APOC2K7ER74 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
APOC4-APOC2K7ER74 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
APOC4-APOC2K7ER74 AC002486.1-201ENST00000435098 391 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
APOC4-APOC2K7ER74 LINC00446-202ENST00000438327 357 ntTSL 3 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
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