Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 AC080013.6-201ENST00000606185 215 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC1.85□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.84□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
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COPS7AQ9UBW8 AC103591.3-201ENST00000608684 209 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
COPS7AQ9UBW8 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
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COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
COPS7AQ9UBW8 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
COPS7AQ9UBW8 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
COPS7AQ9UBW8 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
COPS7AQ9UBW8 MTND1P1-201ENST00000445453 368 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
COPS7AQ9UBW8 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
COPS7AQ9UBW8 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
COPS7AQ9UBW8 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
COPS7AQ9UBW8 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
COPS7AQ9UBW8 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
COPS7AQ9UBW8 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
COPS7AQ9UBW8 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
COPS7AQ9UBW8 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
COPS7AQ9UBW8 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
COPS7AQ9UBW8 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
COPS7AQ9UBW8 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
COPS7AQ9UBW8 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
COPS7AQ9UBW8 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
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COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
COPS7AQ9UBW8 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
COPS7AQ9UBW8 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
COPS7AQ9UBW8 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
COPS7AQ9UBW8 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
COPS7AQ9UBW8 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
COPS7AQ9UBW8 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
COPS7AQ9UBW8 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
COPS7AQ9UBW8 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
COPS7AQ9UBW8 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
COPS7AQ9UBW8 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
COPS7AQ9UBW8 AL096799.1-201ENST00000425900 381 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
COPS7AQ9UBW8 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
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