Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CHD4Q14839 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CHD4Q14839 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CHD4Q14839 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CHD4Q14839 UBE2V1P10-201ENST00000414685 269 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CHD4Q14839 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CHD4Q14839 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CHD4Q14839 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CHD4Q14839 AC073326.1-201ENST00000451832 557 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CHD4Q14839 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CHD4Q14839 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CHD4Q14839 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
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CHD4Q14839 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
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CHD4Q14839 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
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CHD4Q14839 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CHD4Q14839 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CHD4Q14839 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
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CHD4Q14839 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
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CHD4Q14839 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
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CHD4Q14839 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CHD4Q14839 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CHD4Q14839 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
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CHD4Q14839 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
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CHD4Q14839 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
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CHD4Q14839 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CHD4Q14839 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CHD4Q14839 AC025917.1-202ENST00000566344 635 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CHD4Q14839 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CHD4Q14839 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
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CHD4Q14839 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
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CHD4Q14839 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CHD4Q14839 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CHD4Q14839 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CHD4Q14839 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CHD4Q14839 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CHD4Q14839 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CHD4Q14839 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CHD4Q14839 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CHD4Q14839 LINC01691-201ENST00000450546 426 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CHD4Q14839 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CHD4Q14839 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CHD4Q14839 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CHD4Q14839 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CHD4Q14839 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CHD4Q14839 AL021997.1-201ENST00000605757 193 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CHD4Q14839 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CHD4Q14839 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CHD4Q14839 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CHD4Q14839 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CHD4Q14839 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CHD4Q14839 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CHD4Q14839 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CHD4Q14839 RNA5SP457-201ENST00000363657 124 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CHD4Q14839 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CHD4Q14839 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CHD4Q14839 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CHD4Q14839 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CHD4Q14839 AL589823.1-201ENST00000429577 183 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
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