Protein–RNA interactions for Protein: Q14524

SCN5A, Sodium channel protein type 5 subunit alpha, humanhuman

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Length 2,016 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN5AQ14524 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 WHAMMP2-201ENST00000512149 5482 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 RNU2-58P-201ENST00000516403 183 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SCN5AQ14524 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
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