Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TCOF1Q13428 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TCOF1Q13428 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TCOF1Q13428 AC103957.1-202ENST00000519814 735 ntTSL 3 BASIC0.42□□□□□ -2.34
TCOF1Q13428 AP000756.1-201ENST00000532606 679 ntTSL 2 BASIC0.42□□□□□ -2.34
TCOF1Q13428 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TCOF1Q13428 AC024060.1-201ENST00000607052 494 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TCOF1Q13428 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TCOF1Q13428 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TCOF1Q13428 AC078880.5-201ENST00000617845 421 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
TCOF1Q13428 MTCO3P41-201ENST00000414801 328 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TCOF1Q13428 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TCOF1Q13428 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TCOF1Q13428 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC0.41□□□□□ -2.34
TCOF1Q13428 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TCOF1Q13428 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC0.41□□□□□ -2.34
TCOF1Q13428 AL122001.1-201ENST00000457027 370 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TCOF1Q13428 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC0.41□□□□□ -2.34
TCOF1Q13428 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC0.41□□□□□ -2.34
TCOF1Q13428 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TCOF1Q13428 AL132657.2-201ENST00000564417 358 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TCOF1Q13428 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC0.41□□□□□ -2.34
TCOF1Q13428 VN1R82P-201ENST00000601481 356 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TCOF1Q13428 AC098483.2-201ENST00000603158 454 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TCOF1Q13428 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TCOF1Q13428 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TCOF1Q13428 U6.42-201ENST00000618440 107 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TCOF1Q13428 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC0.41□□□□□ -2.34
TCOF1Q13428 AC099654.8-201ENST00000637757 681 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TCOF1Q13428 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TCOF1Q13428 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TCOF1Q13428 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TCOF1Q13428 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TCOF1Q13428 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TCOF1Q13428 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TCOF1Q13428 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC0.41□□□□□ -2.34
TCOF1Q13428 MTND2P9-201ENST00000422293 931 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TCOF1Q13428 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TCOF1Q13428 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TCOF1Q13428 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TCOF1Q13428 BET1P1-201ENST00000482276 359 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TCOF1Q13428 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC0.41□□□□□ -2.34
TCOF1Q13428 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TCOF1Q13428 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TCOF1Q13428 AC093875.1-201ENST00000623688 504 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
TCOF1Q13428 MT-ATP6-201ENST00000361899 681 ntAPPRIS P1 BASIC0.4□□□□□ -2.35
TCOF1Q13428 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TCOF1Q13428 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TCOF1Q13428 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TCOF1Q13428 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TCOF1Q13428 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC0.4□□□□□ -2.35
TCOF1Q13428 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TCOF1Q13428 AC091163.3-201ENST00000518269 1144 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TCOF1Q13428 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TCOF1Q13428 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TCOF1Q13428 AC099566.1-205ENST00000609411 657 ntTSL 5 BASIC0.4□□□□□ -2.35
TCOF1Q13428 AC023158.2-201ENST00000614876 543 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
TCOF1Q13428 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TCOF1Q13428 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TCOF1Q13428 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TCOF1Q13428 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TCOF1Q13428 MTCO1P21-201ENST00000416634 589 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TCOF1Q13428 AL953862.1-201ENST00000423016 168 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TCOF1Q13428 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC0.39□□□□□ -2.35
TCOF1Q13428 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC0.39□□□□□ -2.35
TCOF1Q13428 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TCOF1Q13428 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC0.39□□□□□ -2.35
TCOF1Q13428 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC0.39□□□□□ -2.35
TCOF1Q13428 RNY4P37-201ENST00000516225 96 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TCOF1Q13428 RNU6-758P-201ENST00000516292 89 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TCOF1Q13428 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TCOF1Q13428 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC0.39□□□□□ -2.35
TCOF1Q13428 LINC00907-210ENST00000593316 847 ntTSL 3 BASIC0.39□□□□□ -2.35
TCOF1Q13428 VN1R87P-201ENST00000596706 487 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TCOF1Q13428 AL353778.1-201ENST00000603149 408 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TCOF1Q13428 AL136363.2-201ENST00000604173 851 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TCOF1Q13428 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TCOF1Q13428 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC0.39□□□□□ -2.35
TCOF1Q13428 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TCOF1Q13428 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TCOF1Q13428 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC0.39□□□□□ -2.35
TCOF1Q13428 HTN1-201ENST00000246896 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.38□□□□□ -2.35
TCOF1Q13428 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TCOF1Q13428 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TCOF1Q13428 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TCOF1Q13428 ELOCP9-201ENST00000418624 239 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TCOF1Q13428 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TCOF1Q13428 AP001136.1-201ENST00000425058 635 ntTSL 2 BASIC0.38□□□□□ -2.35
TCOF1Q13428 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TCOF1Q13428 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TCOF1Q13428 AC105129.3-201ENST00000605455 485 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TCOF1Q13428 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TCOF1Q13428 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TCOF1Q13428 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TCOF1Q13428 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
TCOF1Q13428 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
TCOF1Q13428 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
TCOF1Q13428 LINC01676-201ENST00000420901 410 ntTSL 3 BASIC0.37□□□□□ -2.35
TCOF1Q13428 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC0.37□□□□□ -2.35
TCOF1Q13428 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC0.37□□□□□ -2.35
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