Protein–RNA interactions for Protein: Q13136

PPFIA1, Liprin-alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA1Q13136 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
PPFIA1Q13136 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
PPFIA1Q13136 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
PPFIA1Q13136 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
PPFIA1Q13136 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PPFIA1Q13136 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PPFIA1Q13136 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PPFIA1Q13136 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PPFIA1Q13136 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PPFIA1Q13136 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC2.71□□□□□ -1.98
PPFIA1Q13136 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
PPFIA1Q13136 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PPFIA1Q13136 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PPFIA1Q13136 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PPFIA1Q13136 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
PPFIA1Q13136 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
PPFIA1Q13136 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PPFIA1Q13136 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
PPFIA1Q13136 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PPFIA1Q13136 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PPFIA1Q13136 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PPFIA1Q13136 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PPFIA1Q13136 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PPFIA1Q13136 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
PPFIA1Q13136 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
PPFIA1Q13136 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PPFIA1Q13136 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
PPFIA1Q13136 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PPFIA1Q13136 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
PPFIA1Q13136 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PPFIA1Q13136 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PPFIA1Q13136 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PPFIA1Q13136 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PPFIA1Q13136 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PPFIA1Q13136 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PPFIA1Q13136 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PPFIA1Q13136 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PPFIA1Q13136 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PPFIA1Q13136 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PPFIA1Q13136 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PPFIA1Q13136 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PPFIA1Q13136 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PPFIA1Q13136 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PPFIA1Q13136 AC118273.2-201ENST00000532092 465 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PPFIA1Q13136 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PPFIA1Q13136 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PPFIA1Q13136 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PPFIA1Q13136 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PPFIA1Q13136 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PPFIA1Q13136 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PPFIA1Q13136 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
PPFIA1Q13136 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
PPFIA1Q13136 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PPFIA1Q13136 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PPFIA1Q13136 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PPFIA1Q13136 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PPFIA1Q13136 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
PPFIA1Q13136 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
PPFIA1Q13136 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PPFIA1Q13136 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PPFIA1Q13136 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PPFIA1Q13136 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PPFIA1Q13136 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
PPFIA1Q13136 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PPFIA1Q13136 CR383656.11-201ENST00000552261 498 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
PPFIA1Q13136 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PPFIA1Q13136 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PPFIA1Q13136 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PPFIA1Q13136 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PPFIA1Q13136 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PPFIA1Q13136 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
PPFIA1Q13136 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
PPFIA1Q13136 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PPFIA1Q13136 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PPFIA1Q13136 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PPFIA1Q13136 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PPFIA1Q13136 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
PPFIA1Q13136 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PPFIA1Q13136 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
PPFIA1Q13136 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PPFIA1Q13136 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PPFIA1Q13136 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PPFIA1Q13136 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PPFIA1Q13136 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PPFIA1Q13136 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
PPFIA1Q13136 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PPFIA1Q13136 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
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