Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 Gm37744-201ENSMUST00000194616 1590 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms