Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vstm4T1NXB5 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vstm4T1NXB5 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vstm4T1NXB5 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vstm4T1NXB5 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vstm4T1NXB5 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vstm4T1NXB5 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vstm4T1NXB5 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vstm4T1NXB5 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Vstm4T1NXB5 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Vstm4T1NXB5 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vstm4T1NXB5 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vstm4T1NXB5 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vstm4T1NXB5 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vstm4T1NXB5 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vstm4T1NXB5 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vstm4T1NXB5 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vstm4T1NXB5 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vstm4T1NXB5 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vstm4T1NXB5 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Vstm4T1NXB5 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vstm4T1NXB5 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Vstm4T1NXB5 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vstm4T1NXB5 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vstm4T1NXB5 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vstm4T1NXB5 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vstm4T1NXB5 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vstm4T1NXB5 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vstm4T1NXB5 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vstm4T1NXB5 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vstm4T1NXB5 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vstm4T1NXB5 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vstm4T1NXB5 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vstm4T1NXB5 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vstm4T1NXB5 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vstm4T1NXB5 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vstm4T1NXB5 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vstm4T1NXB5 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vstm4T1NXB5 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vstm4T1NXB5 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vstm4T1NXB5 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vstm4T1NXB5 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vstm4T1NXB5 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vstm4T1NXB5 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vstm4T1NXB5 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vstm4T1NXB5 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Vstm4T1NXB5 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vstm4T1NXB5 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vstm4T1NXB5 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vstm4T1NXB5 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vstm4T1NXB5 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vstm4T1NXB5 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vstm4T1NXB5 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vstm4T1NXB5 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vstm4T1NXB5 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vstm4T1NXB5 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vstm4T1NXB5 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vstm4T1NXB5 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vstm4T1NXB5 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vstm4T1NXB5 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vstm4T1NXB5 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vstm4T1NXB5 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vstm4T1NXB5 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vstm4T1NXB5 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vstm4T1NXB5 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vstm4T1NXB5 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vstm4T1NXB5 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vstm4T1NXB5 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vstm4T1NXB5 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vstm4T1NXB5 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vstm4T1NXB5 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vstm4T1NXB5 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vstm4T1NXB5 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vstm4T1NXB5 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vstm4T1NXB5 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vstm4T1NXB5 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vstm4T1NXB5 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vstm4T1NXB5 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vstm4T1NXB5 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vstm4T1NXB5 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vstm4T1NXB5 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vstm4T1NXB5 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vstm4T1NXB5 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vstm4T1NXB5 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vstm4T1NXB5 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vstm4T1NXB5 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vstm4T1NXB5 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vstm4T1NXB5 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vstm4T1NXB5 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vstm4T1NXB5 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vstm4T1NXB5 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vstm4T1NXB5 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vstm4T1NXB5 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vstm4T1NXB5 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vstm4T1NXB5 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vstm4T1NXB5 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vstm4T1NXB5 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vstm4T1NXB5 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Vstm4T1NXB5 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Vstm4T1NXB5 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms