Protein–RNA interactions for Protein: S4R1M3

H2afb2, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afb2S4R1M3 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2afb2S4R1M3 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2afb2S4R1M3 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2afb2S4R1M3 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2afb2S4R1M3 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2afb2S4R1M3 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2afb2S4R1M3 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2afb2S4R1M3 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
H2afb2S4R1M3 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2afb2S4R1M3 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2afb2S4R1M3 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2afb2S4R1M3 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2afb2S4R1M3 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2afb2S4R1M3 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2afb2S4R1M3 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2afb2S4R1M3 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2afb2S4R1M3 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2afb2S4R1M3 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2afb2S4R1M3 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2afb2S4R1M3 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2afb2S4R1M3 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
H2afb2S4R1M3 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
H2afb2S4R1M3 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2afb2S4R1M3 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
H2afb2S4R1M3 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2afb2S4R1M3 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
H2afb2S4R1M3 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2afb2S4R1M3 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2afb2S4R1M3 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2afb2S4R1M3 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2afb2S4R1M3 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2afb2S4R1M3 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2afb2S4R1M3 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2afb2S4R1M3 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2afb2S4R1M3 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2afb2S4R1M3 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2afb2S4R1M3 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2afb2S4R1M3 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2afb2S4R1M3 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2afb2S4R1M3 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2afb2S4R1M3 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2afb2S4R1M3 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2afb2S4R1M3 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
H2afb2S4R1M3 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2afb2S4R1M3 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
H2afb2S4R1M3 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2afb2S4R1M3 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2afb2S4R1M3 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2afb2S4R1M3 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2afb2S4R1M3 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2afb2S4R1M3 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2afb2S4R1M3 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2afb2S4R1M3 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2afb2S4R1M3 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2afb2S4R1M3 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2afb2S4R1M3 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2afb2S4R1M3 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2afb2S4R1M3 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
H2afb2S4R1M3 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2afb2S4R1M3 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2afb2S4R1M3 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2afb2S4R1M3 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2afb2S4R1M3 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2afb2S4R1M3 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2afb2S4R1M3 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2afb2S4R1M3 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2afb2S4R1M3 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2afb2S4R1M3 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2afb2S4R1M3 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2afb2S4R1M3 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2afb2S4R1M3 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2afb2S4R1M3 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2afb2S4R1M3 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
H2afb2S4R1M3 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2afb2S4R1M3 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2afb2S4R1M3 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2afb2S4R1M3 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2afb2S4R1M3 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2afb2S4R1M3 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2afb2S4R1M3 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2afb2S4R1M3 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2afb2S4R1M3 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2afb2S4R1M3 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2afb2S4R1M3 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2afb2S4R1M3 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2afb2S4R1M3 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2afb2S4R1M3 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2afb2S4R1M3 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2afb2S4R1M3 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2afb2S4R1M3 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2afb2S4R1M3 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2afb2S4R1M3 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2afb2S4R1M3 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2afb2S4R1M3 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2afb2S4R1M3 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2afb2S4R1M3 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2afb2S4R1M3 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2afb2S4R1M3 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2afb2S4R1M3 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2afb2S4R1M3 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms