Protein–RNA interactions for Protein: S4R181

Ccdc166, Coiled-coil domain-containing 166, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc166S4R181 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc166S4R181 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms