Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z331

Krt6b, Keratin, type II cytoskeletal 6B, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt6bQ9Z331 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt6bQ9Z331 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt6bQ9Z331 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt6bQ9Z331 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt6bQ9Z331 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt6bQ9Z331 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt6bQ9Z331 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt6bQ9Z331 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt6bQ9Z331 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt6bQ9Z331 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Krt6bQ9Z331 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Krt6bQ9Z331 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Krt6bQ9Z331 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Krt6bQ9Z331 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Krt6bQ9Z331 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt6bQ9Z331 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt6bQ9Z331 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt6bQ9Z331 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt6bQ9Z331 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt6bQ9Z331 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt6bQ9Z331 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt6bQ9Z331 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt6bQ9Z331 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt6bQ9Z331 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt6bQ9Z331 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt6bQ9Z331 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt6bQ9Z331 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt6bQ9Z331 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt6bQ9Z331 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt6bQ9Z331 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt6bQ9Z331 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt6bQ9Z331 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt6bQ9Z331 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt6bQ9Z331 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt6bQ9Z331 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt6bQ9Z331 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt6bQ9Z331 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt6bQ9Z331 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt6bQ9Z331 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt6bQ9Z331 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt6bQ9Z331 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt6bQ9Z331 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt6bQ9Z331 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt6bQ9Z331 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt6bQ9Z331 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt6bQ9Z331 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt6bQ9Z331 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt6bQ9Z331 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt6bQ9Z331 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt6bQ9Z331 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt6bQ9Z331 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt6bQ9Z331 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt6bQ9Z331 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt6bQ9Z331 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt6bQ9Z331 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt6bQ9Z331 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt6bQ9Z331 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt6bQ9Z331 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt6bQ9Z331 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt6bQ9Z331 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt6bQ9Z331 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt6bQ9Z331 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt6bQ9Z331 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt6bQ9Z331 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt6bQ9Z331 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt6bQ9Z331 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt6bQ9Z331 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt6bQ9Z331 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt6bQ9Z331 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt6bQ9Z331 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt6bQ9Z331 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt6bQ9Z331 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt6bQ9Z331 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt6bQ9Z331 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt6bQ9Z331 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt6bQ9Z331 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt6bQ9Z331 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt6bQ9Z331 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt6bQ9Z331 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt6bQ9Z331 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt6bQ9Z331 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt6bQ9Z331 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt6bQ9Z331 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt6bQ9Z331 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt6bQ9Z331 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt6bQ9Z331 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt6bQ9Z331 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt6bQ9Z331 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt6bQ9Z331 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt6bQ9Z331 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt6bQ9Z331 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt6bQ9Z331 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt6bQ9Z331 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt6bQ9Z331 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt6bQ9Z331 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt6bQ9Z331 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt6bQ9Z331 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt6bQ9Z331 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt6bQ9Z331 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt6bQ9Z331 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms