Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Top3bQ9Z321 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Top3bQ9Z321 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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