Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hdac5Q9Z2V6 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hdac5Q9Z2V6 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hdac5Q9Z2V6 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hdac5Q9Z2V6 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hdac5Q9Z2V6 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hdac5Q9Z2V6 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hdac5Q9Z2V6 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hdac5Q9Z2V6 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hdac5Q9Z2V6 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hdac5Q9Z2V6 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hdac5Q9Z2V6 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hdac5Q9Z2V6 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hdac5Q9Z2V6 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hdac5Q9Z2V6 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hdac5Q9Z2V6 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hdac5Q9Z2V6 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hdac5Q9Z2V6 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hdac5Q9Z2V6 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hdac5Q9Z2V6 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hdac5Q9Z2V6 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hdac5Q9Z2V6 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hdac5Q9Z2V6 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hdac5Q9Z2V6 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hdac5Q9Z2V6 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hdac5Q9Z2V6 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hdac5Q9Z2V6 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hdac5Q9Z2V6 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hdac5Q9Z2V6 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hdac5Q9Z2V6 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hdac5Q9Z2V6 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hdac5Q9Z2V6 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hdac5Q9Z2V6 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hdac5Q9Z2V6 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hdac5Q9Z2V6 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hdac5Q9Z2V6 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hdac5Q9Z2V6 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hdac5Q9Z2V6 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Hdac5Q9Z2V6 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hdac5Q9Z2V6 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hdac5Q9Z2V6 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hdac5Q9Z2V6 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hdac5Q9Z2V6 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hdac5Q9Z2V6 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Hdac5Q9Z2V6 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Hdac5Q9Z2V6 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hdac5Q9Z2V6 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hdac5Q9Z2V6 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hdac5Q9Z2V6 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hdac5Q9Z2V6 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hdac5Q9Z2V6 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hdac5Q9Z2V6 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Hdac5Q9Z2V6 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hdac5Q9Z2V6 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hdac5Q9Z2V6 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Hdac5Q9Z2V6 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Hdac5Q9Z2V6 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hdac5Q9Z2V6 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hdac5Q9Z2V6 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hdac5Q9Z2V6 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hdac5Q9Z2V6 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hdac5Q9Z2V6 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hdac5Q9Z2V6 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hdac5Q9Z2V6 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hdac5Q9Z2V6 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hdac5Q9Z2V6 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hdac5Q9Z2V6 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hdac5Q9Z2V6 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hdac5Q9Z2V6 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hdac5Q9Z2V6 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hdac5Q9Z2V6 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hdac5Q9Z2V6 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hdac5Q9Z2V6 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hdac5Q9Z2V6 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hdac5Q9Z2V6 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hdac5Q9Z2V6 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Hdac5Q9Z2V6 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hdac5Q9Z2V6 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Hdac5Q9Z2V6 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hdac5Q9Z2V6 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hdac5Q9Z2V6 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hdac5Q9Z2V6 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hdac5Q9Z2V6 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hdac5Q9Z2V6 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hdac5Q9Z2V6 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hdac5Q9Z2V6 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hdac5Q9Z2V6 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Hdac5Q9Z2V6 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hdac5Q9Z2V6 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hdac5Q9Z2V6 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hdac5Q9Z2V6 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hdac5Q9Z2V6 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hdac5Q9Z2V6 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hdac5Q9Z2V6 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hdac5Q9Z2V6 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hdac5Q9Z2V6 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hdac5Q9Z2V6 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hdac5Q9Z2V6 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hdac5Q9Z2V6 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hdac5Q9Z2V6 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms