Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2J0

Slc23a1, Solute carrier family 23 member 1, mousemouse

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc23a1Q9Z2J0 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc23a1Q9Z2J0 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc23a1Q9Z2J0 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc23a1Q9Z2J0 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc23a1Q9Z2J0 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc23a1Q9Z2J0 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms