Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E2

Mbd1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd1Q9Z2E2 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mbd1Q9Z2E2 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mbd1Q9Z2E2 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Mbd1Q9Z2E2 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms