Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A5

Ate1, Arginyl-tRNA--protein transferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ate1Q9Z2A5 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ate1Q9Z2A5 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ate1Q9Z2A5 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ate1Q9Z2A5 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ate1Q9Z2A5 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ate1Q9Z2A5 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ate1Q9Z2A5 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ate1Q9Z2A5 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ate1Q9Z2A5 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ate1Q9Z2A5 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ate1Q9Z2A5 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ate1Q9Z2A5 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ate1Q9Z2A5 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ate1Q9Z2A5 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ate1Q9Z2A5 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ate1Q9Z2A5 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ate1Q9Z2A5 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ate1Q9Z2A5 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ate1Q9Z2A5 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ate1Q9Z2A5 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ate1Q9Z2A5 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ate1Q9Z2A5 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ate1Q9Z2A5 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ate1Q9Z2A5 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ate1Q9Z2A5 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ate1Q9Z2A5 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ate1Q9Z2A5 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ate1Q9Z2A5 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ate1Q9Z2A5 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ate1Q9Z2A5 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ate1Q9Z2A5 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ate1Q9Z2A5 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ate1Q9Z2A5 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ate1Q9Z2A5 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ate1Q9Z2A5 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ate1Q9Z2A5 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ate1Q9Z2A5 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ate1Q9Z2A5 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ate1Q9Z2A5 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ate1Q9Z2A5 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ate1Q9Z2A5 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ate1Q9Z2A5 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ate1Q9Z2A5 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ate1Q9Z2A5 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ate1Q9Z2A5 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ate1Q9Z2A5 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ate1Q9Z2A5 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ate1Q9Z2A5 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ate1Q9Z2A5 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ate1Q9Z2A5 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ate1Q9Z2A5 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ate1Q9Z2A5 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ate1Q9Z2A5 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ate1Q9Z2A5 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ate1Q9Z2A5 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ate1Q9Z2A5 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ate1Q9Z2A5 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ate1Q9Z2A5 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ate1Q9Z2A5 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ate1Q9Z2A5 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ate1Q9Z2A5 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ate1Q9Z2A5 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ate1Q9Z2A5 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ate1Q9Z2A5 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ate1Q9Z2A5 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ate1Q9Z2A5 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ate1Q9Z2A5 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ate1Q9Z2A5 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ate1Q9Z2A5 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ate1Q9Z2A5 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ate1Q9Z2A5 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ate1Q9Z2A5 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ate1Q9Z2A5 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ate1Q9Z2A5 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ate1Q9Z2A5 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ate1Q9Z2A5 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ate1Q9Z2A5 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ate1Q9Z2A5 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ate1Q9Z2A5 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ate1Q9Z2A5 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ate1Q9Z2A5 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ate1Q9Z2A5 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ate1Q9Z2A5 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ate1Q9Z2A5 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ate1Q9Z2A5 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ate1Q9Z2A5 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ate1Q9Z2A5 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ate1Q9Z2A5 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ate1Q9Z2A5 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ate1Q9Z2A5 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ate1Q9Z2A5 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ate1Q9Z2A5 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ate1Q9Z2A5 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ate1Q9Z2A5 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ate1Q9Z2A5 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ate1Q9Z2A5 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ate1Q9Z2A5 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ate1Q9Z2A5 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ate1Q9Z2A5 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ate1Q9Z2A5 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms