Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdpk1Q9Z2A0 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdpk1Q9Z2A0 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdpk1Q9Z2A0 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdpk1Q9Z2A0 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdpk1Q9Z2A0 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms