Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
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Cldn6Q9Z262 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn6Q9Z262 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn6Q9Z262 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Cldn6Q9Z262 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Cldn6Q9Z262 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Cldn6Q9Z262 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Cldn6Q9Z262 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Cldn6Q9Z262 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Cldn6Q9Z262 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Cldn6Q9Z262 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn6Q9Z262 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Cldn6Q9Z262 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn6Q9Z262 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Cldn6Q9Z262 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn6Q9Z262 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Cldn6Q9Z262 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Cldn6Q9Z262 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Cldn6Q9Z262 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Cldn6Q9Z262 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Cldn6Q9Z262 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn6Q9Z262 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn6Q9Z262 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn6Q9Z262 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn6Q9Z262 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn6Q9Z262 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn6Q9Z262 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn6Q9Z262 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn6Q9Z262 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn6Q9Z262 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn6Q9Z262 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn6Q9Z262 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn6Q9Z262 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn6Q9Z262 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn6Q9Z262 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn6Q9Z262 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn6Q9Z262 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn6Q9Z262 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms