Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z261

Cldn7, Claudin-7, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn7Q9Z261 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn7Q9Z261 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn7Q9Z261 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn7Q9Z261 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn7Q9Z261 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn7Q9Z261 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn7Q9Z261 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn7Q9Z261 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn7Q9Z261 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn7Q9Z261 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn7Q9Z261 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn7Q9Z261 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn7Q9Z261 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn7Q9Z261 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn7Q9Z261 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn7Q9Z261 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn7Q9Z261 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn7Q9Z261 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn7Q9Z261 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn7Q9Z261 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn7Q9Z261 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn7Q9Z261 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn7Q9Z261 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn7Q9Z261 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn7Q9Z261 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn7Q9Z261 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn7Q9Z261 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn7Q9Z261 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn7Q9Z261 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn7Q9Z261 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn7Q9Z261 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn7Q9Z261 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn7Q9Z261 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn7Q9Z261 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn7Q9Z261 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn7Q9Z261 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn7Q9Z261 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn7Q9Z261 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn7Q9Z261 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn7Q9Z261 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn7Q9Z261 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn7Q9Z261 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn7Q9Z261 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn7Q9Z261 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn7Q9Z261 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn7Q9Z261 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn7Q9Z261 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn7Q9Z261 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn7Q9Z261 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn7Q9Z261 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn7Q9Z261 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn7Q9Z261 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn7Q9Z261 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn7Q9Z261 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn7Q9Z261 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn7Q9Z261 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn7Q9Z261 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn7Q9Z261 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn7Q9Z261 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn7Q9Z261 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn7Q9Z261 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn7Q9Z261 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn7Q9Z261 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn7Q9Z261 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn7Q9Z261 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn7Q9Z261 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn7Q9Z261 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn7Q9Z261 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn7Q9Z261 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Cldn7Q9Z261 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn7Q9Z261 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn7Q9Z261 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn7Q9Z261 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn7Q9Z261 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn7Q9Z261 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn7Q9Z261 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn7Q9Z261 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn7Q9Z261 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn7Q9Z261 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn7Q9Z261 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn7Q9Z261 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn7Q9Z261 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn7Q9Z261 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn7Q9Z261 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn7Q9Z261 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn7Q9Z261 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn7Q9Z261 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn7Q9Z261 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn7Q9Z261 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn7Q9Z261 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn7Q9Z261 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn7Q9Z261 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn7Q9Z261 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn7Q9Z261 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn7Q9Z261 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn7Q9Z261 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn7Q9Z261 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn7Q9Z261 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms