Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z140

Cpne6, Copine-6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne6Q9Z140 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Cpne6Q9Z140 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cpne6Q9Z140 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms