Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z121

Ccl8, C-C motif chemokine 8, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl8Q9Z121 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccl8Q9Z121 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms