Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV85

Nme3, Nucleoside diphosphate kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme3Q9WV85 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nme3Q9WV85 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms