Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV27

Atp1a4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1a4Q9WV27 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp1a4Q9WV27 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp1a4Q9WV27 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp1a4Q9WV27 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp1a4Q9WV27 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp1a4Q9WV27 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp1a4Q9WV27 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp1a4Q9WV27 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp1a4Q9WV27 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp1a4Q9WV27 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp1a4Q9WV27 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp1a4Q9WV27 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp1a4Q9WV27 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp1a4Q9WV27 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp1a4Q9WV27 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp1a4Q9WV27 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp1a4Q9WV27 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp1a4Q9WV27 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp1a4Q9WV27 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp1a4Q9WV27 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp1a4Q9WV27 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp1a4Q9WV27 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp1a4Q9WV27 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp1a4Q9WV27 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp1a4Q9WV27 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp1a4Q9WV27 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp1a4Q9WV27 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp1a4Q9WV27 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp1a4Q9WV27 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp1a4Q9WV27 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp1a4Q9WV27 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp1a4Q9WV27 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp1a4Q9WV27 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp1a4Q9WV27 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp1a4Q9WV27 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp1a4Q9WV27 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp1a4Q9WV27 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp1a4Q9WV27 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp1a4Q9WV27 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp1a4Q9WV27 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp1a4Q9WV27 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp1a4Q9WV27 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp1a4Q9WV27 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp1a4Q9WV27 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp1a4Q9WV27 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp1a4Q9WV27 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp1a4Q9WV27 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp1a4Q9WV27 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp1a4Q9WV27 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp1a4Q9WV27 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp1a4Q9WV27 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp1a4Q9WV27 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp1a4Q9WV27 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp1a4Q9WV27 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp1a4Q9WV27 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp1a4Q9WV27 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp1a4Q9WV27 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp1a4Q9WV27 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp1a4Q9WV27 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp1a4Q9WV27 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp1a4Q9WV27 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp1a4Q9WV27 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp1a4Q9WV27 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp1a4Q9WV27 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp1a4Q9WV27 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp1a4Q9WV27 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp1a4Q9WV27 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp1a4Q9WV27 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp1a4Q9WV27 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp1a4Q9WV27 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp1a4Q9WV27 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp1a4Q9WV27 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp1a4Q9WV27 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp1a4Q9WV27 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp1a4Q9WV27 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp1a4Q9WV27 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp1a4Q9WV27 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp1a4Q9WV27 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp1a4Q9WV27 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp1a4Q9WV27 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp1a4Q9WV27 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp1a4Q9WV27 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp1a4Q9WV27 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp1a4Q9WV27 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp1a4Q9WV27 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp1a4Q9WV27 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp1a4Q9WV27 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp1a4Q9WV27 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp1a4Q9WV27 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp1a4Q9WV27 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp1a4Q9WV27 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp1a4Q9WV27 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp1a4Q9WV27 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp1a4Q9WV27 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp1a4Q9WV27 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp1a4Q9WV27 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp1a4Q9WV27 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp1a4Q9WV27 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp1a4Q9WV27 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp1a4Q9WV27 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms